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RSS订阅原创 应用统计学与R语言实现笔记（番外篇四）——bookdown使用与OR值计算
本期是之前做的应用统计学与R语言实现笔记的番外篇四，本期主要关注两个问题，一个是重新利用R的bookdown包创建新的电子书，另一个是计算公共卫生当中一个比较常见的指标OR值。文章目录1 bookdown使用2 公式更正3 OR值计算1 bookdown使用bookdown是谢益辉之前开发的R语言包，可以基于rmarkdown快速生成在线电子书，并且可以输出pdf和epub。具体的使用方法可以参见官方文档。https://bookdown.org/yihui/bookdown/这里由于中文在输
2021-03-17 19:43:16
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原创 Coding and Paper Letter（八十七）
大家新年好，新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.针对R语言新手的shiny培训教程。shiny beginners2.R语言包tinter，用于获取颜色的色调和阴影。tinter3.Power BI的培训研讨会。pbiworkshops4.使用C语言的API测试GEOS的性能。geos performance5.R语言包exploreRGEE，探索RGEE-Google Earth Engine的包。exploreRGEE6.Sh
2021-03-09 05:38:34
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原创 Coding and Paper Letter（八十六）
大家新年好，新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包radiant.basics，使用R和shiny的商业分析软件包。radiant.basics2.一个用于探索和发布数据的开源多功能工具，Datasette是用于浏览和发布数据的工具。 它可以帮助人们获取任何形状或大小的数据，并将其发布为交互式，可探索的网站和API。datasette3.关于作者硕士论文的技术部分，基于Google Earth Engine实现的结合Landsat和Sen
2021-01-08 05:15:38
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原创 Coding and Paper Letter（八十五）
新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.阿根廷地质协会（AGA）于2020年8月和9月提供的“地理信息学应用于多专题制图”课程的虚拟课程。AGA Geoinformatica 20202.R语言包glmmTMB，基于Template Model Builder拟合广义线性混合效应模型。glmmTMB3.Python库rich，是一个Python库，用于在终端中显示富文本和精美格式。rich4.Python库Mici，提供了概率模型中近似推论的马
2020-12-18 19:07:11
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原创 Coding and Paper Letter（八十四）
最近忙于研究事宜，许久未归。新一期资源整理博客。1 Coding:1.Python的Geohash编码压缩工具。georaptor2.基于Google Earth Engine平台用于洪涝灾害的水文遥感分析包。hydra floods3.Python库moto，一个使您能够轻松模拟基于AWS基础架构的测试的库。moto4.R语言包helpr，可以改善友好的HTML文档。helpr5.Binder实例与地理信息科学和技术知识体系的章节进行交互。bok chapter notebook
2020-11-25 18:23:28
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原创 Suomi NPP VIIRS夜间灯光遥感数据简介与下载（一）——数据介绍，FTP下载与hdf5读取
失踪人口回归+爷青回，本篇介绍下Suomi NPP VIIRS夜间灯光遥感数据下载。文章目录1 夜间灯光遥感数据简介2 夜间灯光遥感数据下载1 年和月尺度产品下载2 日尺度产品下载3 NPP夜间灯光遥感数据读取与可视化1 Google Earth Engine2 日尺度hdf5数据读取与可视化（ENVI）3 日尺度hdf5数据读取与可视化（R语言）1 夜间灯光遥感数据简介夜间灯光遥感数据就是指利用遥感技术捕捉夜晚地球上的灯光分布状况，可以有效反映人类活动的空间分布，因此常用于各类社会经济数据方面的遥
2020-09-09 05:03:39
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原创 Coding and Paper Letter（八十三）
新一期资源整理博客。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.快速生成三维球几何图形。fast icosphere2.mapskin是地理空间可缩放矢量图标的集合。mapskin3.Python库TSFRESH，自动从时间序列中提取相关特征。tsfresh4.R语言包tsfeatures，从时间序列数据中提取各种特征。tsfeatures5.xarray的教程。提供样例的jupyter notebook。xarray tutorial6.用React组件渲
2020-06-18 18:24:33
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原创 解决LeanCloud流控问题以及配置DaoVoice
最近hexo博客的评论系统valine遇上一点问题，本篇就来记录下我的解决方法。文章目录1 LeanCloud流控问题2 DaoVoice1 LeanCloud流控问题如果用valine评论系统的同学最近打开valine部署的日志可能会发现诸如此类的信息。事实上我在valine的用户群里有看到相关的官方消息。其实就是大家都用这套系统，导致有点负载不了。因此官方做了控制。所以解决方式无非就是交钱（付费版不限制）或者用其他方式唤醒LeanCloud。这个的方案目前我看到的有几种，有一位大佬写了博客
2020-06-03 05:24:37
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原创 Coding and Paper Letter（八十二）
新一期资源整理博客。1 Guide：Coding and Paper Letter这个系列的博客第一篇起源于2018年7月7日，做这个系列的初衷可以用下面这张图来代表，我手机上关注的公众号在一天时间内可以推送给我193条推送，信息量之大可见一斑。当前是一个快速阅读或者叫快餐式阅读的时代，大量的信息堆砌。因此我发觉资源整理是非常关键的。于是在7月7日我正式开始在博客上更新这个系列，在此期间也收到了不少读者的评论。当然我自己也受益良多。这个系列其实就是针对我看到的一些coding资源以及泛读论文（读题目
2020-05-29 22:30:58
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原创 关于GIS的一些感悟·思考
本文想法和初步动笔起源于10号，但是最近事情比较多，一直到现在才完稿。其实起源是从5月初本科学弟学妹的毕业答辩开始的，主要谈一谈听完答辩的感悟以及对于GIS学科的一些引申思考。文章目录1 Defence:2 Topics1 Defence:由于疫情的原因，今年本科学院的学弟学妹毕业论文答辩采用了腾讯会议网上形式。不过由于各种原因，听得比较完整的还是直系基地GIS方向的答辩，因此也就针对这几个内容稍微提点东西。先Po一下大家的题目。一共是9位参与答辩。第一位是基于新浪微博对洪水灾害时间主题挖掘与淹
2020-05-21 07:58:44
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原创 Tutorial of the Website "Awesome of COVID-19"
My Ph.D. project will focus on the application of spatial technology in Spatial Lifecourse Epidemiology. With the pandemic of COVID-19, I built up a website, “Awesome of COVID-19”, which collected the...
2020-05-08 04:58:00
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原创 Coding and Paper Letter（八十一）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper1 Coding:1.负责任的可重复性计算机研究指南。reproducible research guidelines2.模拟数据并拟合2种物种的居住模型的代码。论文"A multispecies occupancy model for two or more interacting species"的代码实现。bayes2spe...
2020-04-24 07:32:19
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原创 WSL数据科学环境使用小记
之前在笔记本上搭载了WSL数据科学环境，关于环境搭建的博文日志如下。本文记录一下使用过程中遇到的两个小问题。用Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台文章目录1 WSL挂载移动硬盘2 RStudio Server plot字体显示1 WSL挂载移动硬盘最近在处理全国公里级别的栅格数据，这类数据量比较大，我准备直接从移动硬盘里进行读取处理，然后就发现了一个小问题，WS...
2020-04-10 00:59:40
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原创 R语言实现voronoi treemap可视化
今天带来一篇承诺虾神的R语言可视化博客。关于voronoi treemap的可视化。文章目录1 任务布置过程2 voronoi treemap简介3 voronoi treemap的R语言可视化实现1 任务布置过程感谢虾神，刀爷和魄爷实名出镜。事实上这是刀爷看到澎湃美数课发的一篇推送文章其中一张图产生的疑问，感兴趣的可以点击原文。刀爷问的是如何实现上图的可视化，这就是任务布置的由来...
2020-04-01 06:03:13
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原创 应用统计学与R语言实现笔记（番外篇三）——缺失值的相关系数分析
昨天刚好有位同学来咨询R语言里计算相关系数的一些问题，所以来谈谈关于缺失值的相关系数分析问题，主要是在R语言中如何处理含缺失值数据的相关系数分析。文章目录1 问题描述2 R语言相关分析中的缺失值处理原理3 “Pairwise-complete correlation considered dangerous”案例1 问题描述相关分析可以说是数据分析以及探索性分析的基础。一般拿到手的数据，起...
2020-03-31 04:02:06
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原创 葵花8号卫星数据简介与下载（一）——数据介绍与FTP下载
今天来介绍葵花8号卫星数据以及下载流程。文章目录1 葵花8号卫星数据简介2 葵花8号卫星数据下载1 葵花8号卫星数据简介JMA于2015年7月7日开始运营Himawari-8，以取代MTSAT-2（也称为Himawari-7）。 Himawari-9号卫星于2017年3月10日开始后备运行。两颗卫星都位于向东约140.7度的轨道上，并将观测东亚和西太平洋区域15年。 源自Himawari-...
2020-03-26 05:04:39
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原创 Coding and Paper Letter（八十）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.城市模拟综合。UrbanSimulationSynthesis2.基于 bookdown 的 ElegantBook。ElegantBookdown3.R语言包lifecycle，生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。lifecycle4.学习GitHub注册的基础知识，进行首次回购，...
2020-03-25 06:01:10
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原创 Coding and Paper Letter（七十九）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.图灵方式的主机存储库:如何引导一个可重复的数据科学项目。the turing way2.COVID-19新型冠状病毒的样本数据处理（R语言）。Coronavirus sample processing3.野火极端事件的时空模拟。wildfire extremes4.sqlite3的egg插件。e...
2020-03-20 08:03:15
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原创 Coding and Paper Letter（七十八）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包tinyProject，R语言用户的轻量级数据分析框架。tinyProject2.全球变化评估模型（Global Change Assessment Model, GCAM）的共享经济路径（Shareing Socioeconomic Pathway, SSP）情景结果。ssp data3.线性...
2020-03-18 07:27:34
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原创 Coding and Paper Letter（七十七）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper：1 Coding:1.用于无服务器计算的安全快速微处理器。firecracker2.R语言包ggthemeassist，一个RStudio的Add-in插件用于调整ggplot2主题里的一些绘图细节（文字，边框，颜色）。ggthemeassist3.数据框概念的Matlab实现。DataFrame4.数据科学访谈的问题与回...
2020-03-08 23:13:01
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原创 Coding and Paper Letter（七十六）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.遥感变化检测相关资源。awesome remote sensing change detection2.计算机组成原理流水线资源。awesome pipeline3.R语言包salmix，用极大似然方法拟合时间序列数据的概率分布。salmix4.实现地球动图的代码与说明。earth atlas of...
2020-03-04 06:59:21
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原创 Coding and Paper Letter（七十五）
新一期资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.在暑期课程学习后，实现芝加哥单车出租情况的可视化。Divvy可视化图片2.现代地统计数据分析——Rstudio 2020年会分会材料。geospatial3.ggplot2的相关资源整理。awesome ggplot24.Earthaxiv的一篇论文相关代码。题目为“The contribution...
2020-02-27 01:55:10
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原创 应用统计学与R语言实现笔记（番外篇二）——假设检验更正
今天的文章想从统计学的角度——假设检验，来回顾最近的疫情。同时也是刚好有之前应用统计学与R语言实现笔记假设检验一章中的的错误更正。关于假设检验的内容，详情见下面的博客。应用统计学与R语言实现学习笔记（六）——假设检验文章目录1 细心的读者与更正2 p值含义解读、假设检验结论与统计学决策3 放弃p值，yes or no？1 细心的读者与更正首先感谢简书平台上这位叫“十七颗青彩”的读者，她提出...
2020-02-21 01:45:03
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原创 阿里云打造Jupyterlab数据科学环境
本篇博客主要解决阿里云服务器上Jupyterlab配置方面的一些问题，关于安装教程详情见之前的这篇博客。Windows的Linux子系统搭建数据科学环境文章目录1 安装完无法启动Jupyterlab2 解决第一个问题以后出现OSError3 允许root账户登录4 Jupyter lab配置文件生成1 安装完无法启动Jupyterlab首先声明，我在Anaconda3安装过程中已经设置了...
2020-02-19 07:44:45
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原创 Ubuntu安装GDAL 2.1
希望疫情早日得到控制，今天来回顾下之前提到的如何在Linux系统下安装GDAL，本文以Ubuntu为例。文章目录1 GDAL简介2 Ubuntu安装教程3 rgdal安装与样例4 GDAL其他安装方式1 GDAL简介GDAL全称为Geospatial Data Abstraction Library，是当前GIS和遥感领域最为知名和基础的开源库。它实现了基础的栅格与矢量文件的读写以及众多相关...
2020-02-06 04:24:16
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原创 Coding and Paper Letter（七十三）
来荷兰以后第一次更文。还是熟悉的资源整理栏目！提前给大家拜个早年。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包rgee，Google Earth Engine的R接口。非官方库，从实现上来看，其实是借助R调用Python。rgee2.任何一个城市的道路可视化，在微博上已经先看到的一个可视化案例。数据来源OSM。city roads[外链图片转存失败,源站...
2020-01-21 00:07:50
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原创 阿里云配置Rstudio Server数据科学环境
新年快乐！之前有两篇相关的博客，欢迎大家温习。这次其实与前面的安装没有啥两样，就是把之前的WSL换成了阿里云的服务器。用Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台Windows的Linux子系统搭建数据科学环境文章目录1 阿里云上安装RStudio Server2 RStudio Server操作1 阿里云上安装RStudio Server首先需要现在阿里云的Ubu...
2020-01-02 00:17:16
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原创 hexo+NexT博客最新定制记录
最近对hexo和NexT博客又做了一次定制。文章目录1 增加clustrmaps2 视频播放3 pdf预览4 增加天气卡片5 主题自定义设计1 增加clustrmaps这回在博客里增加一个clustrmaps的地球点击效果，之前尝试了下，失败了，这回成功显示了。这个功能需要先在这个网页注册。效果如图：后面只需要把对应的代码添加到文件中。有人推荐放到这个路径下：themes\next\la...
2019-12-24 01:00:58
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原创 Coding and Paper Letter（七十二）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.自动设置GOMAXPROCS以匹配Linux容器CPU配额。automaxprocs2.文言文編程語言。今天来自机器之心的推送，虽然我已经先看到了。来自CMU大四的大佬。wenyan lang3.此程序包中的文件采用云优化的GeoTIFF格式，可以在PROJ 7或更高版本的PROJ数据目录中解压缩。proj ...
2019-12-18 23:02:38
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原创 Coding and Paper Letter（七十一）
这个系列有点久没更新，最近事情比较多。后面会继续坚持资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.R语言包ggcorrplot2，ggplot2的拓展包，类似于corrplot包的功能，用于绘制相关系数图。在这个系列的第十七篇里有另一个相关的包，有兴趣的同学可以做下比较。ggcorrplot22.R代码的分析，可重现研究与审查。CodeDepends3....
2019-12-14 00:54:38
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原创 阿里云安装nginx配置网站
本期带来一篇最近在阿里云服务器上折腾nginx配置网站的教程。文章目录1 nginx简介2 阿里云安装nginx3 配置nginx4 基本命令以及错误1 nginx简介nginx是一个轻量级的web服务器，我的认知，这东西跟负载平衡不分家。这里抄下度娘简介。Nginx是一款轻量级的Web 服务器/反向代理服务器及电子邮件（IMAP/POP3）代理服务器，在BSD-like 协议下发行。其...
2019-12-02 00:12:16
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原创 带南海九段线分位数地图可视化（R语言版）
今天带来一篇承诺虾神的可视化博客。内容是使用R语言进行带南海九段线分位数地图可视化。虾神的原博文地址如下（Python版）。Python实现带南海九段线分位数地图完整可视化版本（附代码及数据）1999-2017年中国各省旅游外汇收入分析及可视化（附代码及数据）数据及代码github地址文章目录1 数据下载1 git clone2 直接下载（Download ZIP）2 R语言可视化1 所需...
2019-11-13 01:34:50
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原创 Coding and Paper Letter（七十）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.JupyterHub的流量模拟器。hubtraf2.前端面试手册。front end interview handbook3.Python学习课程。learn python4.从ArcGIS/ESRI格式中提取栅格数据。从Readme来看，似乎在寻求GDAL大佬加持共同构建程序。ArcRasterResc...
2019-08-31 01:44:49
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原创 Coding and Paper Letter（六十九）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.基于Python和Matplotlib的日历热图。calendar heatmap2.这是一个独立的（Python / Flask）和基于Lambda的动态控件，用于S3托管的GeoTIFF。 它也是一组用于转码和以其他方式准备栅格数据以供渲染器渲染的实用程序。marblecutter3.GOLEM是一种数值...
2019-08-23 00:18:39
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原创 Coding and Paper Letter（六十八）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.Python库heartrate，用于简单实时地可视化Python程序的执行。heartrate2.Python库clusterpy，空间约束聚类算法库。clusterpy3.2020年APS介绍R研讨会的材料。APS IntroR 20204.使用空间数据的统计和机器学习模型的超参数调整和性能评估。p...
2019-08-16 17:04:08
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原创 Coding and Paper Letter（六十七）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.matplotlib的初学者教程。matplotlib tutorial2.加州大学伯克利分校IT研究主页。ucb-rit.github.io3.最新教程材料的仓库来自华盛顿大学2019年ICESat-2 Hack Week。ICESat2 hackweek tutorials4.强化学习算法的实现。 Py...
2019-08-10 21:25:22
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原创 Coding and Paper Letter（六十六）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.mars是一种基于张量的统一框架，用于大规模数据计算。mars2.SVGD是一种通用的变分推理算法，它形成梯度下降的自然对应物以进行优化。 SVGD通过应用一种最小化KL散度的函数梯度下降形式，迭代地传输一组粒子以匹配目标分布。该软件包包含Matlab和Python语言的SVGD实现。 还提供演示以在我们的论文中重...
2019-08-06 22:18:11
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原创 Coding and Paper Letter（六十五）
由于忙于硕士毕业相关事宜，非常久没有更新博客，现在回来更新博客，第一篇还是资源整理类。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.USGS EROS数据分发系统的API接口，非官方API。espa api2.R语言包Taipan，Taipan是一种在准备分析时注释图像的工具。taipan3.R语言包sugarbag，创建用于可视化地理空间数据的镶嵌六边形地图。 定...
2019-08-02 15:48:56
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原创 Coding and Paper Letter（六十四）
资源整理。文章目录1 Coding:2 Paper:1 Coding:1.交互式瓦片编辑器。tile playground2.R语言包autokeras，autokeras的R接口。autokeras是一个开源的自动机器学习的软件。autokeras3.斯坦福网络分析平台，用于网络分析与图挖掘学习。snap4.高级NLP与spaCy：免费在线课程。spacy course5....
2019-04-19 17:43:05
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原创 用Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台
前一段介绍过利用Windows系统的Ubuntu子系统搭建数据科学平台，此番来介绍下除了jupyter之外的另外一个数据科学神器：RStudio Server。同时基于Ubuntu和RStudio Server搭建一个R语言的云平台，用于数据分析。文章目录1 RStudio Server简介2 R语言云平台搭建3 Hello World1 RStudio Server简介RStudio S...
2019-04-15 15:15:57
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