天南星科系统发育及全基因组复制事件的研究取得新进展

天南星科系统发育及全基因组复制事件的研究取得新进展

天南星科(包括浮萍类,但不包括菖蒲属)约有144 属3645种,是单子叶植物泽泻目最为多样化的类群之一,具有多样的形态和生态习性。在分子系统学兴起之前,菖蒲属长期被置于天南星科,目前已被证实为单子叶植物最早分化的类群;浮萍类则常长期被处理成独立的科。此前的研究表明天南星科的祖先栖息地与水生或湿地环境有关。该科90%的属和95%的种分布在热带和亚热带地区,仅少数种分布在温带。其中,核心天南星科分支(True-Araceae)占所有属的94%和所有种的98.7%,以热带雨林为多样化中心,大多数物种具有陆生或附生习性。中国科学院昆明植物研究所在天南星科研究方面有着长期的积累,李恒研究员先后完成或牵头完成了《中国植物志》第13卷第2分册(天南星科和浮萍科)和《中国植物志(英文版)》(Flora of China)第23卷菖蒲科、天南星科和浮萍科的编研。2008年以后,叶绿体和线粒体基因数据被应用于天南星科系统发育关系的研究中,但鲜有基于转录组数据的研究的报道。此外,全基因组复制(WGD)在天南星科演化中的作用也不清楚。

近日,中国科学院昆明植物研究所李德铢研究员领导的“植物多样性与基因组学”团队与美国宾州州立大学马红教授团队及国内多位研究者合作,依托中国西南野生生物种质资源库,收集了天南星科57属81个代表种的样品,利用转录组测序(RNA-Seq)和基因组浅层测序(

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