R语言学习笔记
花访蕊
啥都想学的小白一枚,多多指教!
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R语言用ggplot2制作火山图笔记
```{r}##加载R包library(ggplot2)library(ggrepel)###加载数据data <- allDiff###加一列genedata$gene <- rownames(data)###确定X轴、Y轴ggplot(data=data, aes(x=logFC, y =-log10(P.Value))) + ## 画点,x轴小于等于1的点为黑色 geom_point(data=subset(data,abs(data$logFC) <= .原创 2021-09-24 11:04:36 · 2588 阅读 · 1 评论 -
在R语言里用ggplot2做箱式图和散点图笔记
一、画箱式图###加载R包library(ggpubr)library(ggplot2)###加载数据getwd()load(file = "D:/BaiduNetdiskDownload/果子生信/Guozi_Maincourse/2021-test/2021.9.24/data/TCGA_steal_data.Rdata")###加入比较数据,这里是把subgroup列里其他元素和normal比较,将数据储存在my_comparisons中my_comparisons <-原创 2021-09-26 10:22:55 · 6645 阅读 · 3 评论 -
R语言中用ggplot2做泡泡图
怎么说呢,简单是简单,但是把一堆数处理成能画图的数据对新手来讲还是挺有挑战性的以下是加载R包处理数据的内容###加载R包library(dplyr)library(tidyr)library(tibble)library(ggpubr)###读取数据getwd()load(file = "D:/BaiduNetdiskDownload/果子生信/Guozi_Maincourse/2021-test/2021.9.24/data/TCGA_steal_data.Rdata")#处理数原创 2021-09-26 15:40:21 · 1697 阅读 · 1 评论