利用TESLA GPU和MATLAB实现大规模型数据并行处理

最新推荐文章于 2021-03-22 07:08:03 发布
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文章标签： matlab cuda fortran math 数据中心 float
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版权
Math works, nvidia

Matlab2011a的解决方案

陈炜

Matlab2011 在gpu上的应用

华平

2007 Tesla宣布

gpu有快速的浮点处理能力

第一代的x86没有浮点处理单元，8087

已经成为业界主流的架构

512个核，非常适合做并行的运算

真实的应用软件加速

分子动力学

基因的排序，检索

两类 计算密集型 内存带宽密集型

gpu在这两类都具有较大的优势

最新的tesla，m2090，以后还有c
665g float
开普勒

浮点运算的能力

软件的支撑环境

cuda c/c++

fortran，与pgi合作

M卡面向数据中心，大客户，oem
m2050，2070，2090
c卡 单独增加gpu计算能力

性能提高班5xx到665
c++更好的支持

中山大学 300多台

amber分子动力学
世界最快的amber模拟

休斯顿 hess 石油天然气 地震资料处理

彭博社 债券定价系统

cuda⒋0的改进

cuda x86
没有gpu的情况下，可以开发gpu的程序
fraannk
关注
基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动
Rockyoung
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基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动 这里我只取了4个点，Ar原子用L-J势函数描述。 基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动前言 前言 ...
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运行matlab卡,Tesla K40c加速卡的安装已使用（2）软件篇
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前言在硬件篇中已经安装了Tesla K40加速卡安装在机箱中，接下来详细记录一下软件环境的搭建，更深层地，试着研究如何将该卡应用在大型工程运算中，主要是Visual Studio和Matlab环境下的运算。软件安装环境为了应对以后可能出现的这种错误，现记录搭建环境的过程，以及在实验室PC中的实际情况。先上搭建环境的官方教程该教程不仅给出了环境搭建方法，环境搭建成功与否的测试方法，还给出了普通vs工...
matlab 分子动力学,两体的分子动力学模型-MATLAB源程序
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03-17 1677
两原子的分子动力学模拟-MATLAB程序%假设两个原子的质量相同，都设为1%两原子之间的相互作用势为Lennard-Jones势clear;clc;n=1000;%模拟步数，可修改r1=zeros(n,3);%原子1的坐标r2=zeros(n,3);%原子2的坐标v1=zeros(n,3);%原子1的速度v2=zeros(n,3);%原子2的速度f1=zeros(n,3);%原子1受到的力f2=z...
atom:Matlab中的原子拓扑操作，用于操纵分子动力学或蒙特卡洛模拟系统的脚本
05-29
Matlab 中的原子拓扑操作，即用于构建和操作分子模拟单元的 matlab 脚本，用于例如分子动力学或蒙特卡罗模拟。 原子脚本和函数的目的是实现复杂和各向异性多组分分子系统的构建和分析的自动化，并生成具有键、角度和二面角的拓扑信息。 从以下位置下载整个函数库：Matlab Filexchange | GitHub 另请参阅以下链接： html文档 这些脚本/函数可以为我做什么？ 通过发出一些 Matlab 命令，您可以轻松地构建新的定制分子系统，通常是通过发出如下命令： oneunitcell=import_atom('someunitcell.pdb') % 取一些单元格，例如mineral=replicate_atom(oneunitcell,Box_dim,[6 4 1]) % 复制单元格6x4x1 次mineral_ff=clayff_atom(mineral,...
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07-10
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近年来，使用GPU(通用图形处理器)进行科学计算已变得十分普遍。GPU最初设计用于图像密集型视频游戏产业中的图形渲染绘制，但近年来GPU不断发展，现可用于更广泛的用途。研究人员可对其进行程序设计以执行计算，用于数据分析、数据可视化，以及金融和生物建模等应用。MATLAB的GPU支持为活跃于许多学科的大量研究人员(不一定是CUDA编程专家)提供了一种加速科学计算的新方法。考虑到MATLAB主要是用于...
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【时间】2018.10.12 【题目】MATLAB上的GPU加速计算   概述 怎样在MATLAB上做GPU计算呢?主要分为三个步骤：数据的初始化、对GPU数据进行操作、把GPU上的数据回传给CPU   一、数据的初始化 首先要进行数据的初始化。有两种方法可以进行初始化：一是先在CPU上设置好数据然后拷贝到GPU；二是直接在GPU上初始化数据。 1.1.先看看第一种方案：使用gpu...
记一次服务器GPU跑程序问题的坑
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问题 之前在ubuntu的服务器上一直使用python3.5跑训练程序， 突然用不了python3.5了，显示tensorflow找不到gpu，只能在cpu上跑，尴尬。 用的是原来一字未改的程序也只能用cpu跑，忙活了半天 解决 问了学长，发现他们都能跑，很纳闷，一度准备让管理员注销账户再开一个，怀疑是权限问题或者包混乱 最后偶然发现学长们都在服务器上用py2.7跑，据说tensorflow-gp...
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我的代码： h1>close allclear allclc% open parpool skip error if it was openedtry parpool(24); end% Sample input. It is faked, just for demo.% Number of "lamps" and number of "blinks" are similar to real...
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NVIDIA的GPU产品主要有GeForce、Tesla和Quadro三大系列，虽然从硬件角度来看它们都采用同样的架构设计，也都支持用作通用计算(GPGPU)，但因为它们分别面向的目标市场以及产品定位的不同，这三个系列的GPU在软硬件的设计和支持上都存在许多差异。其中Quadro的定位是专业用途显卡而Tesla的定位是专业的GPGPU，单价相对较高，也都很少会被用作其他用途。...
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matlab 设置最大并行数_Matlab并行效率问题
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02-01 1823
本帖最后由 xidianbianjiang 于 2013-10-10 16:26 编辑大家好，我所用的机器为实验室24核的工作站，按照Matlab的说明，单机最多使用12个worker。首先，我想问，matlab单机有可能使用更多的核吗？因为我看原来math老大在一个回帖中提到购买license可以单机用更多的核，但一直没有找到更多的信息。其次，就我自己的实践来说，我的程序改为并行后速度只提高的不...
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"本书《大规模并行处理器程序设计》深入探讨了如何利用并行计算提升程序性能，特别是通过GPU（图形处理单元）实现高效的并行运算。书中介绍了一种名为CUDA的数据并行语言，它是针对NVIDIA GPU架构设计的，并详细讲解...
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