基于方向连接性的医学图像分割——DconnNet

基于方向连接性的医学图像分割——DconnNet

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项目介绍

DconnNet是一个基于Pytorch实现的深度学习框架，用于CVPR 2023论文《Directional Connectivity-based Segmentation of Medical Images》中的算法。这个开源项目提供了对医学图像进行精准分割的新方法，通过方向连接性（directional connectivity）来改善传统的像素级分类策略。除了主模型DconnNet外，还提供了另一个简单连接性方法BiconNet供用户参考。

项目技术分析

DconnNet的核心是利用方向连接性损失函数来进行训练，它包括两个关键组件：

1. 连通性矩阵转换：将分割掩模转化为连通性掩模，强调相邻像素间的关联。
2. 双边投票：在连通性基础上执行投票，并将其转换回分割图，以获得更精确的边界信息。

此外，代码结构清晰，train.py是主要文件，定义了参数和GPU选择；solver.py包含了训练和测试的具体细节；connect_loss.py则是损失函数所在的地方，包含连通性矩阵计算和双边投票方法。

项目及技术应用场景

DconnNet适用于各种医学图像分割任务，如眼科扫描图像（例如Retouch数据集）、皮肤病变图像（ISIC2018数据集）以及儿童眼底血管图像（CHASEDB1数据集）。该技术尤其适合处理具有复杂边缘或需要高精度定位的任务，如肿瘤检测、血管追踪等。

项目特点

1. 创新的连接性策略：通过考虑像素间的方向关系，提高了分割的准确性，特别对于轮廓边缘的识别有显著提升。
2. 灵活易用：用户可以轻松将自己的数据加载器整合到项目中，并自定义训练参数，适应不同场景需求。
3. 预训练模型与预测结果：提供预训练模型和示例预测结果，便于快速验证和对比效果。
4. 可扩展性：不仅支持单类别分割，也支持多类别任务，并且用户可以根据需要调整矩阵偏移策略。
5. 详细的文档指导：清晰的代码结构和说明文档，帮助用户理解并应用该模型。

如果你正在寻找一个能够提高医学图像分割准确度的工具，或者希望探索连接性在图像分割中的潜力，那么DconnNet无疑是你的理想选择。现在就加入这个项目，一起推进医学影像分析的技术边界吧！

为了正确引用本工作，请使用以下引用格式：

Z. Yang and S. Farsiu, "Directional Connectivity-based Segmentation of Medical Images," in CVPR, 2023, pp. 11525-11535.

项目链接

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