探索高效医疗图像处理的未来:FAST 框架
项目介绍
FAST
是一个专为医疗图像处理、神经网络推理和可视化设计的开放源码框架。它利用现代 C++、OpenCL 和 OpenGL 技术,以及如 TensorRT、OpenVINO、TensorFlow 和 ONNX Runtime 等神经网络库,简化了在多核 CPU 和 GPU 上实现高性能计算的过程。
项目技术分析
FAST
的核心特性包括:
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数据流处理:无论是静态还是动态/时序数据,其处理管道都能无缝对接,无需修改代码。它可以从电影文件、Web 摄像头、Intel RealSense 相机、图像序列甚至直接从超声扫描仪(如 Clarius)中流式传输数据。
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深度学习集成:提供了统一的神经网络接口,支持多种模型格式(ONNX、protobuf、SavedModel、OpenVINO),并兼容多个后端(Google TensorFlow、NVIDIA TensorRT、Intel OpenVINO、Microsoft ONNX Runtime),使创建实时神经网络管道变得更加容易。
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高级数据管理:
FAST
数据对象在所有处理器上都代表数据,并保持跨存储区域的数据一致性,减轻了开发者的内存管理负担。 -
广泛的数据格式支持:支持 DICOM、metaimage (MHD)、NIFTI、普通 JPG/PNG/BMP 图像、视频、HDF5、VTK polydata、全切片图像、超声文件等多种数据格式和类型。
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高性能算法:拥有许多基于 OpenCL 的并行高性能算法实现,如Marching Cubes 表面提取、高斯平滑、非局部均值、块匹配跟踪和种子区域生长等。
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快速并发可视化:渲染和计算在独立线程中进行,确保流畅的响应式可视化。支持 3D 和 2D 多种类型的可视化,包括网格、点、线、图像切片和体积渲染,以及二维图像、图像切片和分割/标签渲染等。
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互操作性:
FAST
可与 Python 集成,并能轻松融入现有的 Qt 应用程序。
应用场景
在医学研究和临床实践中,FAST
可用于实时图像分析、神经网络模型的即时应用、医学影像的高效处理与可视化。例如,可用于自动超声图像分割、CT 扫描的表面重建、全切片显微镜图像查看以及实时追踪病灶变化等。
项目特点
- 灵活性:无论数据是静态还是动态,单一的处理流程可以适应各种数据类型和来源。
- 易用性:提供 C++ 和 Python 教程,便于快速入门;示例丰富,文档详细。
- 性能优化:通过充分利用硬件资源(CPU 和 GPU),实现高效的图像处理和深度学习推理。
- 多样化:广泛的数据格式支持和多种算法选择,满足不同应用场景需求。
- 可扩展性:可以通过插件和扩展与现有系统无缝整合,易于定制和升级。
如果你正在寻找一个强大的工具来处理、分析和可视化医疗图像,那么 FAST
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