Variational Bayesian Monte Carlo (VBMC) 指南

Variational Bayesian Monte Carlo (VBMC) 指南

vbmcVariational Bayesian Monte Carlo (VBMC) algorithm for posterior and model inference in MATLAB项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/vb/vbmc

项目概述

Variational Bayesian Monte Carlo (VBMC) 是一个在MATLAB中实现的算法，用于执行后验分布和模型推断的工具。本指南旨在帮助用户理解其内部结构、关键文件以及如何开始使用这个强大的库。

1. 项目目录结构及介绍

VBMC的项目结构组织有序，便于开发者理解和使用：

• .gitignore: 控制版本控制系统应忽略哪些文件。
• LICENSE: 包含项目使用的BSD-3-Clause开源许可协议。
• README.md: 主要的项目说明文档，提供快速入门、功能概览和贡献指导。
• 源代码:
  • vbmc.m, vbmc_diagnostics.m, vbmc_examples.m 等：核心函数和示例脚本，是用户交互的主要入口点。
  • utils, private, shared 文件夹分别存储通用工具函数、私有函数和共享资源。
  • 特定功能文件，如vbmc_pdf.m, vbmc_plot.m等，处理PDF生成、绘图等功能。
• examples 或 vbmc_examples.m: 可能包含示范如何使用VBMC的实例代码，引导新用户快速上手。
• tests: 单元测试或示例数据，确保功能正确性。
• 文档相关: 可能存在的其他文档或教程，虽然在此引用内容中未详细列出。

2. 项目的启动文件介绍

• 主要启动文件通常指的是vbmc.m，这是用户开始使用VBMC进行推断的核心入口点。通过调用这个脚本，你可以指定输入模型、参数和所需的推断设置来开始VBMC过程。

  要启动VBMC，您可能需要准备数据、定义目标（似然）函数，并调用该函数以开始计算后验分布。例如：

  % 示例调用（具体参数需根据实际需求设定）
  result = vbmc(modelDefinition, options);
  

• 配置与初始化往往不是通过单独的“配置文件”完成，而是通过传递到VBMC函数的参数结构体完成。这些选项可以包括迭代次数、学习率、初始化方法等。

3. 项目的配置文件介绍

由于VBMC是基于MATLAB的一个库，它更倾向于通过函数调用时传入的参数结构体来定义配置，而不是传统的配置文件方式。这意味着配置参数通常在调用VBMC函数前被直接设置在MATLAB的工作环境中。

例如，创建一个配置可能会看起来像这样：

options = struct('iterations', 1000, 'learningRate', 0.1, ...);
result = vbmc(yourModelFunction, options);

在这里，没有直接的.ini或.json配置文件用于设置，所有的配置都是通过MATLAB变量直接传递给VBMC函数。

请注意，对于更复杂的项目管理和配置管理，用户可能自定义脚本来准备这些结构体，间接实现了配置的管理和重用。

通过遵循上述指南，用户能够有效地探索并利用VBMC项目来进行高效的贝叶斯推断。

vbmcVariational Bayesian Monte Carlo (VBMC) algorithm for posterior and model inference in MATLAB项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/vb/vbmc