Gap Statistic 项目使用教程
1. 项目的目录结构及介绍
Gap Statistic 项目的目录结构如下:
gap_statistic/
├── cargo/
├── github/workflows/
├── conda-recipe/
├── gap_statistic/
│ ├── __init__.py
│ ├── optimalK.py
│ └── ...
├── src/
├── tests/
├── .gitattributes
├── .gitignore
├── CHANGELOG.md
├── Cargo.lock
├── Cargo.toml
├── Example.ipynb
├── LICENSE-MIT
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── UNLICENSE
├── pyproject.toml
├── pytest.ini
├── setup.cfg
└── setup.py
目录介绍
cargo/
: 包含 Rust 相关的配置文件。github/workflows/
: 包含 GitHub Actions 的工作流配置文件。conda-recipe/
: 包含 Conda 包的构建配置文件。gap_statistic/
: 项目的主要代码目录,包含 Python 模块和脚本。src/
: 可能包含 Rust 源代码。tests/
: 包含项目的测试代码。.gitattributes
和.gitignore
: Git 配置文件。CHANGELOG.md
: 项目更新日志。Cargo.lock
和Cargo.toml
: Rust 项目的依赖和配置文件。Example.ipynb
: 示例 Jupyter Notebook。LICENSE-MIT
和UNLICENSE
: 项目许可证文件。MANIFEST.in
: 打包配置文件。README.md
: 项目说明文档。pyproject.toml
: Python 项目的配置文件。pytest.ini
: pytest 配置文件。setup.cfg
和setup.py
: 项目打包和安装配置文件。
2. 项目的启动文件介绍
项目的启动文件主要是 gap_statistic/optimalK.py
,这个文件包含了计算 Gap Statistic 的主要逻辑和方法。
optimalK.py
文件介绍
OptimalK
类:提供了计算最佳聚类数的方法。plot_results
方法:用于在 Jupyter Notebook 中绘制结果图。
3. 项目的配置文件介绍
项目的配置文件主要包括以下几个:
setup.py
这个文件用于项目的打包和安装。它定义了项目的元数据、依赖项和安装脚本。
from setuptools import setup, find_packages
setup(
name='gap-stat',
version='2.0.3',
packages=find_packages(),
install_requires=[
# 依赖项列表
],
# 其他元数据
)
pyproject.toml
这个文件是 Python 项目的配置文件,定义了构建系统的要求和其他项目配置。
[build-system]
requires = ["setuptools", "wheel"]
Cargo.toml
如果项目中使用了 Rust 扩展,这个文件定义了 Rust 项目的依赖和配置。
[package]
name = "gap-stat"
version = "0.1.0"
edition = "2018"
# 依赖项
[dependencies]
pytest.ini
这个文件是 pytest 的配置文件,定义了测试运行时的配置选项。
[pytest]
addopts = --cov=gap_statistic
以上是 Gap Statistic 项目的基本使用教程,涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。