探索数据的黄金分割——Gap统计量的Python实现

探索数据的黄金分割——Gap统计量的Python实现

gap_statisticDynamically get the suggested clusters in the data for unsupervised learning.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ga/gap_statistic

在数据分析领域中,确定数据集中的最佳聚类数量一直是一项挑战。Gap Statistic,一种由Tibshirani等人提出的高效算法,提供了一种动态识别建议聚类数目的方法。本文将向您介绍一个优秀的开源项目——Gap Statistic的Python(和Rust)实现,它将帮助您解决这个难题。

项目介绍

Gap Statistic是一个开源库,能够基于Tibshirani等人的论文所提出的Gap方法,自动评估并选择给定数据集中最理想的簇的数量。该项目不仅提供了易于使用的接口,还支持多线程加速计算,确保了分析效率的同时也提升了用户体验。

技术分析

该库利用多种策略来估算最优的聚类数目:

  1. 最大Gap值法:选取使Gap值最大的k
  2. 差值准则:采用论文中提出的方法,即当Gap(k) ≥ Gap(k+1) - s(k+1)时,选取最小的k
  3. 最大化Gap*值:这是一种替代方案,旨在避免过估问题,并能为某些无法应用原Gap统计的场景提供解。

通过这些策略,项目提供了灵活的选择方式,让用户根据具体需求挑选最适合的数据分类结果。

此外,项目还提供了可自定义的集群器功能,允许用户注入自己的聚类算法或参数,这极大地增强了其灵活性和实用性。

应用场景

Gap Statistic适用于各种需要无监督学习的数据分析任务中,特别是在那些要求智能判断数据自然分组的场合。无论是处理图像分析中的物体识别,还是挖掘文本数据的主题分布,或是探索大规模数据的内在结构,本项目都能为您提供有价值的洞察和辅助决策依据。

例如,在市场营销领域,它可以用于客户细分,帮助企业更准确地定位目标市场;在生物学研究中,则可用于基因表达模式的解析,揭示细胞类型之间的差异。

项目特点

  • 高质量的代码维护:虽然作者提到因个人时间限制而进入维护模式,但对任何社区提交的问题和拉取请求持开放态度,保证了库的基本稳定性和持续改进的可能性。
  • 全面的安装选项:除了标准的Python版本,还有带Rust扩展的安装选项,显著提高了计算性能,特别是对于大数据集的处理更加高效。
  • 详尽的结果展示:通过DataFrame形式展现每一步聚类过程的关键指标,包括Gap值、Gap*值及相关误差估计,以及可视化工具,帮助用户直观理解分析结果。
  • 高定制性:用户可以轻松指定并行后端(JobLib、Rust或Multiprocessing)、自定义聚类函数及其参数,满足特定环境下的优化需求。

总之,Gap Statistic不仅是数据分析专家手中的利器,也是初学者入门机器学习聚类分析的理想起点。它以强大的功能和简洁的设计,让每一个细节都服务于提高数据理解力的目标。不论是学术研究还是商业实践,使用这一工具都将带来前所未有的便捷和精确度提升。我们诚邀广大开发者和数据科学家加入到这一开源生态中,共同探索数据背后的无限可能。

gap_statisticDynamically get the suggested clusters in the data for unsupervised learning.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ga/gap_statistic

  • 10
    点赞
  • 4
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
使用 Python 实现 Gap 统计法可以分为以下几个步骤: 1. 导入所需模块,包括 numpy、scipy、sklearn 等。 ``` python import numpy as np from scipy import stats from sklearn.cluster import KMeans ``` 2. 定义计算 Gap 统计的函数 gap_statistic。 ``` python def gap_statistic(X, k_max=10, B=10): """ 计算 Gap 统计 :param X: 数据集 :param k_max: 最大的聚类数 :param B: 随机数据集的数 :return: Gap 统计数组 """ # 定义 SSE 数组 sse = np.zeros(k_max) # 定义随机 SSE 数组 sse_rand = np.zeros((k_max, B)) # 定义 Gap 统计数组 gap = np.zeros(k_max) # 计算实际 SSE for k in range(1, k_max + 1): kmeans = KMeans(n_clusters=k).fit(X) sse[k - 1] = kmeans.inertia_ # 计算随机 SSE for b in range(B): X_rand = np.random.rand(*X.shape) kmeans_rand = KMeans(n_clusters=k).fit(X_rand) sse_rand[k - 1, b] = kmeans_rand.inertia_ # 计算 Gap 统计 gap[k - 1] = np.mean(np.log(sse_rand[k - 1])) - np.log(sse[k - 1]) return gap ``` 其中,参数 X 是数据集,k_max 是最大的聚类数,B 是随机数据集的数。函数中,先定义实际 SSE 数组、随机 SSE 数组和 Gap 统计数组,然后分别计算实际 SSE、随机 SSE 和 Gap 统计。 3. 加载数据集,调用 gap_statistic 函数计算 Gap 统计。 ``` python # 加载数据集 X = np.loadtxt("data.txt") # 计算 Gap 统计 gap = gap_statistic(X) ``` 4. 绘制 Gap 统计随聚类数 k 变化的曲线。 ``` python import matplotlib.pyplot as plt # 绘制 Gap 统计曲线 plt.plot(range(1, len(gap) + 1), gap, '-o') plt.xlabel('Number of clusters k') plt.ylabel('Gap statistic') plt.show() ``` 完整的代码如下: ``` python import numpy as np from scipy import stats from sklearn.cluster import KMeans import matplotlib.pyplot as plt def gap_statistic(X, k_max=10, B=10): """ 计算 Gap 统计 :param X: 数据集 :param k_max: 最大的聚类数 :param B: 随机数据集的数 :return: Gap 统计数组 """ # 定义 SSE 数组 sse = np.zeros(k_max) # 定义随机 SSE 数组 sse_rand = np.zeros((k_max, B)) # 定义 Gap 统计数组 gap = np.zeros(k_max) # 计算实际 SSE for k in range(1, k_max + 1): kmeans = KMeans(n_clusters=k).fit(X) sse[k - 1] = kmeans.inertia_ # 计算随机 SSE for b in range(B): X_rand = np.random.rand(*X.shape) kmeans_rand = KMeans(n_clusters=k).fit(X_rand) sse_rand[k - 1, b] = kmeans_rand.inertia_ # 计算 Gap 统计 gap[k - 1] = np.mean(np.log(sse_rand[k - 1])) - np.log(sse[k - 1]) return gap # 加载数据集 X = np.loadtxt("data.txt") # 计算 Gap 统计 gap = gap_statistic(X) # 绘制 Gap 统计曲线 plt.plot(range(1, len(gap) + 1), gap, '-o') plt.xlabel('Number of clusters k') plt.ylabel('Gap statistic') plt.show() ```
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

贺妤娅

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值