nf-core/eager 项目教程

nf-core/eager 项目教程

eagerA fully reproducible and state-of-the-art ancient DNA analysis pipeline项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ea/eager

1. 项目的目录结构及介绍

nf-core/eager/
├── bin/
├── conf/
├── docs/
├── environment.yml
├── LICENSE
├── main.nf
├── nextflow.config
├── README.md
├── results/
└── subworkflows/

目录结构介绍

• bin/: 包含项目的可执行脚本文件。
• conf/: 包含项目的配置文件。
• docs/: 包含项目的文档文件。
• environment.yml: 定义项目所需的依赖环境。
• LICENSE: 项目的开源许可证文件。
• main.nf: 项目的主启动文件。
• nextflow.config: 项目的全局配置文件。
• README.md: 项目的介绍和使用说明。
• results/: 存储项目运行结果的目录。
• subworkflows/: 包含项目的子工作流文件。

2. 项目的启动文件介绍

main.nf

main.nf 是 nf-core/eager 项目的主启动文件。它定义了整个工作流的流程和步骤。通过运行 nextflow run main.nf 可以启动项目。

3. 项目的配置文件介绍

nextflow.config

nextflow.config 是项目的全局配置文件，用于定义项目的各种配置参数，如资源分配、工作流参数、环境变量等。

environment.yml

environment.yml 文件定义了项目运行所需的环境依赖，通常用于 Conda 环境的管理。

conf/

conf/ 目录下包含项目的各种配置文件，如流程配置、资源配置等。这些配置文件可以根据需要进行修改，以适应不同的运行环境。

eagerA fully reproducible and state-of-the-art ancient DNA analysis pipeline项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ea/eager