nf-core/eager 项目教程
1. 项目的目录结构及介绍
nf-core/eager/
├── bin/
├── conf/
├── docs/
├── environment.yml
├── LICENSE
├── main.nf
├── nextflow.config
├── README.md
├── results/
└── subworkflows/
目录结构介绍
- bin/: 包含项目的可执行脚本文件。
- conf/: 包含项目的配置文件。
- docs/: 包含项目的文档文件。
- environment.yml: 定义项目所需的依赖环境。
- LICENSE: 项目的开源许可证文件。
- main.nf: 项目的主启动文件。
- nextflow.config: 项目的全局配置文件。
- README.md: 项目的介绍和使用说明。
- results/: 存储项目运行结果的目录。
- subworkflows/: 包含项目的子工作流文件。
2. 项目的启动文件介绍
main.nf
main.nf
是 nf-core/eager 项目的主启动文件。它定义了整个工作流的流程和步骤。通过运行 nextflow run main.nf
可以启动项目。
3. 项目的配置文件介绍
nextflow.config
nextflow.config
是项目的全局配置文件,用于定义项目的各种配置参数,如资源分配、工作流参数、环境变量等。
environment.yml
environment.yml
文件定义了项目运行所需的环境依赖,通常用于 Conda 环境的管理。
conf/
conf/
目录下包含项目的各种配置文件,如流程配置、资源配置等。这些配置文件可以根据需要进行修改,以适应不同的运行环境。