TPOT2 开源项目教程

TPOT2 开源项目教程

tpot2A Python Automated Machine Learning tool that optimizes machine learning pipelines using genetic programming. 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/tp/tpot2

1. 项目介绍

TPOT2 是一个基于 Python 的自动化机器学习工具，它使用遗传编程来优化机器学习管道。TPOT2 是 TPOT 的重写版本，增加了一些额外的功能，特别是支持基于图的管道和额外的参数，以更好地指定所需的搜索空间。目前，TPOT2 处于 Alpha 阶段，这意味着在开发过程中可能会有一些 API 的向后不兼容更改，并且某些已实现的功能可能存在 bug。

2. 项目快速启动

安装 TPOT2

首先，确保你已经安装了 Python。推荐使用 conda 环境来安装 TPOT2：

conda create --name tpot2env python=3.10
conda activate tpot2env

对于 M1 Mac 或其他 Arm 架构的 CPU 用户，需要先安装兼容的 lightgbm 版本：

conda install --yes -c conda-forge 'lightgbm>=3.3.3'

然后，安装 TPOT2：

pip install TPOT2

使用 TPOT2

以下是一个简单的使用示例：

import tpot2

# 加载数据
X, y = load_my_data()

# 创建 TPOT2 分类器
est = tpot2.TPOTClassifier()

# 训练模型
est.fit(X, y)

# 进行预测
predictions = est.predict(X)

3. 应用案例和最佳实践

最佳实践

1. 并行处理：TPOT2 使用 dask 进行并行处理。当 Python 被并行化时，每个模块都会在每个进程中导入。因此，在从脚本运行 TPOT2 时，重要的是将所有代码保护在 if __name__ == "__main__": 中。这在从笔记本运行 TPOT2 时不是必需的。

   # my_analysis.py
   import tpot2
   
   if __name__ == "__main__":
       X, y = load_my_data()
       est = tpot2.TPOTClassifier()
       est.fit(X, y)
       # 其余分析代码
   

2. 自定义目标函数：在设计自定义目标函数时，避免使用全局变量。

   # 不要这样做
   global_X = [[1, 2], [4, 5]]
   global_y = [0, 1]
   
   def foo(est):
       return my_scorer(est, X=global_X, y=global_y)
   

应用案例

TPOT2 可以应用于各种机器学习任务，如分类、回归等。以下是一个简单的分类任务示例：

import tpot2
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split

# 加载数据
data = load_iris()
X = data.data
y = data.target

# 分割数据集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.25)

# 创建 TPOT2 分类器
est = tpot2.TPOTClassifier()

# 训练模型
est.fit(X_train, y_train)

# 进行预测
predictions = est.predict(X_test)

4. 典型生态项目

TPOT2 作为一个自动化机器学习工具，可以与其他数据科学和机器学习工具集成，形成一个强大的生态系统。以下是一些典型的生态项目：

• Scikit-learn：TPOT2 可以与 Scikit-learn 无缝集成，使用其丰富的预处理和模型评估工具。
• Dask：TPOT2 使用 Dask 进行并行处理，可以与 Dask 的其他功能（如分布式计算）结合使用。
• LightGBM：TPOT2 支持 LightGBM，这是一个高效的梯度提升框架，特别适用于大规模数据集。

通过这些生态项目的结合，TPOT2 可以提供更强大的自动化机器学习解决方案。

tpot2A Python Automated Machine Learning tool that optimizes machine learning pipelines using genetic programming. 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/tp/tpot2