MoLFormer 项目使用教程

MoLFormer 项目使用教程

molformer项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/molformer

1. 项目的目录结构及介绍

MoLFormer 项目的目录结构如下：

molformer/
├── data/
│   ├── processed/
│   └── raw/
├── models/
│   ├── __init__.py
│   ├── molformer.py
│   └── utils.py
├── notebooks/
│   ├── example_notebook.ipynb
│   └── visualization.ipynb
├── scripts/
│   ├── train.py
│   ├── evaluate.py
│   └── predict.py
├── tests/
│   ├── test_model.py
│   └── test_utils.py
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── requirements.txt
└── setup.py

目录结构介绍

• data/: 存放项目的数据文件，包括原始数据 (raw/) 和处理后的数据 (processed/)。
• models/: 存放模型的定义和相关工具函数。
  • __init__.py: 初始化文件。
  • molformer.py: MoLFormer 模型的定义。
  • utils.py: 模型相关的工具函数。
• notebooks/: 存放 Jupyter Notebook 文件，用于数据分析和可视化。
  • example_notebook.ipynb: 示例 Notebook，展示如何使用 MoLFormer 模型。
  • visualization.ipynb: 用于数据可视化的 Notebook。
• scripts/: 存放项目的脚本文件，包括训练、评估和预测脚本。
  • train.py: 训练模型的脚本。
  • evaluate.py: 评估模型的脚本。
  • predict.py: 进行预测的脚本。
• tests/: 存放测试文件，用于测试模型的功能。
  • test_model.py: 测试模型的脚本。
  • test_utils.py: 测试工具函数的脚本。
• .gitignore: Git 忽略文件，指定不需要版本控制的文件和目录。
• LICENSE: 项目的开源许可证。
• README.md: 项目的说明文档。
• requirements.txt: 项目依赖的 Python 包列表。
• setup.py: 项目的安装脚本。

2. 项目的启动文件介绍

MoLFormer 项目的启动文件主要是 scripts/train.py 和 scripts/evaluate.py。

scripts/train.py

该文件用于训练 MoLFormer 模型。启动方式如下：

python scripts/train.py --config path/to/config.yaml

scripts/evaluate.py

该文件用于评估训练好的 MoLFormer 模型。启动方式如下：

python scripts/evaluate.py --model_path path/to/model --data_path path/to/data

3. 项目的配置文件介绍

MoLFormer 项目的配置文件通常是一个 YAML 文件，用于指定训练和评估的参数。以下是一个示例配置文件的内容：

model:
  name: "molformer"
  hidden_size: 768
  num_layers: 12
  num_heads: 12
  dropout: 0.1

training:
  batch_size: 32
  learning_rate: 0.0001
  num_epochs: 10
  save_path: "checkpoints/"

data:
  train_path: "data/processed/train.csv"
  val_path: "data/processed/val.csv"
  test_path: "data/processed/test.csv"

配置文件介绍

• model: 定义模型的参数，包括模型的名称、隐藏层大小、层数、注意力头数和 dropout 率。
• training: 定义训练的参数，包括批量大小、学习率、训练轮数和模型保存路径。
• data: 定义数据的路径，包括训练数据、验证数据和测试数据的路径。

通过修改配置文件，可以调整模型的训练和评估过程。

molformer项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/molformer