NIfTI 图像转换器：轻量级神经影像处理工具

NIfTI 图像转换器：轻量级神经影像处理工具

NIfTI-Image-Converter🖼 A lightweight neuroimaging .nii to .png converter for Matlab and Python users项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ni/NIfTI-Image-Converter

项目介绍

NIfTI 图像转换器 是一个专为神经影像学设计的简易工具，它允许用户将 .nii 格式的图像文件转换为更为普遍使用的 .png 格式。该工具由 Alexander Laurence 开发，并且兼容 Matlab 和 Python 两个平台，为医学成像和计算机视觉研究者提供了便利。支持从 R2017b 版本的 Matlab 起的所有后续版本，以及 Python 3.7 及以上环境。

项目快速启动

安装与设置

1. 克隆仓库: 首先，你需要通过 Git 克隆此项目到本地:

   git clone https://github.com/alexlaurence/NIfTI-Image-Converter.git
   

2. Matlab 使用:

   • 将项目路径添加到 Matlab 的路径中。
   • 运行时，只需在命令窗口输入 nii2png 并回车。

3. Python 使用:

   • 确保你有适当的环境（Python 3.7+），然后导航到项目目录。

   • 在终端或命令提示符中执行以下命令来运行转换器:

     python nii2png.py
     

     或指定输入输出路径:

     python nii2png.py -i <path_to_nifti_file>.nii -o <output_directory>/png/
     

示例

以 Python 运行为例：

cd NIfTI-Image-Converter
python nii2png.py --input /path/to/your/brain.nii --output ./output/png/

这将会把指定的 .nii 文件转换成 .png 格式并保存在指定的输出目录下。

应用案例和最佳实践

神经科学研究中，将复杂的神经影像数据转换为可视化图片对于论文发表、报告展示或团队内部交流至关重要。利用 NIfTI 图像转换器，研究人员可以高效地预览和共享特定脑区的图像，简化了图像编辑和注释流程。最佳实践中，建议在转换前后仔细校验图像的方向和质量，确保正确无误地传达研究结果。

典型生态项目

虽然本项目本身是独立的，但在神经科学和医疗图像处理领域，它可以与其他如 FSL（FMRIB's Software Library）、AFNI (Analysis of Functional NeuroImages) 或 FreeSurfer 等生态项目结合使用，用于图像数据的前处理、分析之后的可视化展示。例如，在完成复杂的数据分析之后，用 NIfTI Image Converter 快速转换结果图像，以便于进一步的图形编辑或在非专业软件中的演示。

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这个简单易用的工具不仅加速了神经影像数据的标准化流程，也为跨学科合作提供了便利，尤其是在需要直观展示研究成果的场景下。

NIfTI-Image-Converter🖼 A lightweight neuroimaging .nii to .png converter for Matlab and Python users项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ni/NIfTI-Image-Converter