GEOparse：Python库访问基因表达综合数据库（GEO）

GEOparse：Python库访问基因表达综合数据库（GEO）

GEOparse Python library to access Gene Expression Omnibus Database (GEO) 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ge/GEOparse

GEOparse 是一个开源的 Python 库，主要用于从基因表达综合数据库（GEO）中查询和检索数据。该项目主要使用 Python 编程语言开发。

核心功能

GEOparse 的核心功能包括：

• 下载 GEO 系列数据集，如 SOFT 文件。
• 下载 GEO 系列的补充文件，以便在本地使用。
• 将 GEO SOFT 文件加载为易于使用和操作的对象。
• 为 GEO 上传准备数据。

最近更新的功能

项目最近的更新主要包括以下几个方面：

• 增加了对 SOFT 文件兼容性的检查。
• 扩展了 GEOTypes 对象，增加了用于差异表达分析的有用函数。
• 鼓励用户分享想法，增加更多测试，以持续改进库的功能和稳定性。

GEOparse 项目的持续更新和完善，为生物信息学研究者在处理基因表达数据方面提供了极大的便利。通过这个库，研究者可以更高效地从 GEO 数据库中获取和准备数据，为后续的科学研究打下坚实的基础。

GEOparse Python library to access Gene Expression Omnibus Database (GEO) 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ge/GEOparse