DeepSMILES 开源项目教程
1. 项目的目录结构及介绍
DeepSMILES 项目的目录结构如下:
deepsmiles/
├── LICENSE.txt
├── MANIFEST.in
├── README.rst
├── VERSIONS.rst
├── setup.py
└── deepsmiles/
├── __init__.py
├── converter.py
├── decoder.py
├── encoder.py
└── errors.py
目录介绍
LICENSE.txt
: 项目的许可证文件,采用 MIT 许可证。MANIFEST.in
: 用于指定在打包时包含的文件。README.rst
: 项目的说明文档。VERSIONS.rst
: 项目的版本历史记录。setup.py
: 用于安装项目的脚本。deepsmiles/
: 项目的主要代码目录。__init__.py
: 初始化文件,使目录成为一个 Python 包。converter.py
: 转换器模块,用于将 SMILES 转换为 DeepSMILES 和反向转换。decoder.py
: 解码器模块,用于将 DeepSMILES 解码为 SMILES。encoder.py
: 编码器模块,用于将 SMILES 编码为 DeepSMILES。errors.py
: 错误处理模块,定义了转换过程中可能出现的错误。
2. 项目的启动文件介绍
项目的启动文件是 setup.py
,它是一个标准的 Python 安装脚本。通过运行以下命令可以安装 DeepSMILES:
pip install --upgrade deepsmiles
setup.py
文件负责项目的打包和安装,确保所有依赖项正确安装,并且项目可以作为一个 Python 包使用。
3. 项目的配置文件介绍
DeepSMILES 项目没有显式的配置文件,其配置主要通过代码中的参数进行设置。例如,在使用 deepsmiles.Converter
类时,可以通过参数 rings
和 branches
来控制是否启用环和分支的转换:
import deepsmiles
print("DeepSMILES version: %s" % deepsmiles.__version__)
converter = deepsmiles.Converter(rings=True, branches=True)
print(converter)
通过这种方式,用户可以根据需要灵活配置转换器的行为。
以上是 DeepSMILES 开源项目的教程,涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些内容能帮助你更好地理解和使用 DeepSMILES 项目。