GraphTrans 开源项目教程

GraphTrans 开源项目教程

graphtrans项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gr/graphtrans

项目介绍

GraphTrans 是一个用于图神经网络的项目，旨在通过全局注意力机制来表示图神经网络中的长程上下文。该项目在 NeurIPS 2021 上发表，并提供了 PyTorch 代码实现。GraphTrans 通过使用 Transformer 模块来学习图中的长程成对关系，并引入了一种新颖的“readout”机制来获取全局图嵌入。

项目快速启动

环境设置

首先，确保你已经安装了 conda。然后，使用以下命令创建并激活环境：

conda env create -f requirement.yml
conda activate graphtrans

运行示例

以下是一个运行 GraphTrans 的示例命令，以 OGBG-Code2 数据集为例：

# GraphTrans (GCN-Virtual)
python main.py --configs configs/code2/gnn-transformer/JK=cat/pooling=cls+norm_input.yml --runs 5

# GraphTrans (GCN)
python main.py --configs configs/code2/gnn-transformer/no-virtual/pooling=cls+norm_input.yml --runs 5

应用案例和最佳实践

数据集 OGBG-Code2

GraphTrans 在 OGBG-Code2 数据集上表现出色，以下是一些配置和结果：

• GraphTrans (GCN):

  • Valid: 0.1599±0.0009
  • Test: 0.1751±0.0015

• GraphTrans (PNA):

  • Valid: 0.1622±0.0025
  • Test: 0.1765±0.0033

• GraphTrans (GCN-Virtual):

  • Valid: 0.1661±0.0012
  • Test: 0.1830±0.0024

数据集 OGBG-Molpcba

在 OGBG-Molpcba 数据集上，GraphTrans 同样取得了优异的成绩：

• GraphTrans (GIN):

  • Valid: 0.2893±0.0050
  • Test: 0.2756±0.0039

• GraphTrans (GIN-Virtual):

  • Valid: 0.2867±0.0022
  • Test: 0.2761±0.0029

典型生态项目

GraphTrans 作为一个图神经网络项目，与以下生态项目紧密相关：

• PyTorch: 项目的主要开发框架，提供了强大的深度学习工具。
• OGB (Open Graph Benchmark): 提供了多个标准化的图数据集，用于评估图神经网络的性能。
• Transformer: 项目中使用的核心技术，用于学习图中的长程关系。

通过这些生态项目的支持，GraphTrans 能够更好地处理复杂的图结构数据，并在多个任务上达到最先进的结果。

graphtrans项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gr/graphtrans