微软健康数据匿名化工具使用指南
1. 项目目录结构及介绍
此开源项目位于 GitHub 上,专为处理医疗数据匿名化而设计,支持Fast Healthcare Interoperability Resources(FHIR)和DICOM数据格式。下面是项目的主要目录结构概述:
docs
: 包含了关于FHIR和DICOM数据匿名化的文档说明。FHIR
: 此部分涉及具体处理FHIR数据匿名化的代码和工具。src
: 源代码目录,包含R4和STU3版本的命令行工具实现。Microsoft Health Fhir Anonymizer R4 CommandLineTool
: R4版本的匿名化工具源码。Microsoft Health Fhir Anonymizer Stu3 CommandLineTool
: STU3版本的工具源码。
- 配置和样例文件可能散落于这些子目录中,用于指导如何配置和使用工具。
.gitignore
,CODE_OF_CONDUCT.md
,LICENSE
,README.md
,SECURITY.md
: 标准的Git忽略文件、行为准则、许可证、项目读我文件和安全指南。nuget.config
,release.yml
: 有关包管理和持续集成的配置。
2. 项目的启动文件介绍
该项目提供了命令行工具作为主要交互方式,用于匿名化数据。有两个主要的可执行文件用于不同的FHIR标准版本:
-
Microsoft Health Fhir Anonymizer R4 CommandLineTool.exe
- 位于
$SOURCE\FHIR\src\Microsoft Health Fhir Anonymizer R4 CommandLineTool\bin\Debug|Release\net6.0
路径下,用于处理基于R4标准的FHIR资源文件。
- 位于
-
Microsoft Health Fhir Anonymizer Stu3 CommandLineTool.exe
- 位于
$SOURCE\FHIR\src\Microsoft Health Fhir Anonymizer Stu3 CommandLineTool\bin\Debug|Release\net6.0
路径下,适用于STU3版本的数据。
- 位于
启动匿名化流程是通过调用相应的命令行工具完成的,需指定输入和输出目录等参数。
3. 项目的配置文件介绍
匿名化过程依赖于配置文件来定义匿名规则。尽管具体的配置文件名或位置在提供的引用中未明确给出,一般而言,这类工具会要求用户提供一个或多个JSON或者XML格式的配置文件,用来指定哪些数据元素应被替换、加密或删除以确保匿名化。配置文件通常会指定如Pseudonymization(伪名化)、De-identification(去识别化)的标准和策略,例如使用FHIRPath表达式来选择要处理的数据字段。
为了使用该工具,用户需要创建或提供这样一个配置文件,并可能通过命令行参数指向它。虽然教程示例没有直接展示配置文件的例子,但用户可以依据FHIR和DICOM匿名化的官方文档来构建自己的配置文件。配置文件是匿名化过程中非常关键的一环,它允许用户定制化处理规则,以适应不同的隐私保护需求和合规性要求。
通过上述指南,开发者可以初步了解如何操作这个工具,进行健康数据的安全匿名化处理。详细的操作步骤和高级使用方法建议参考项目内更详细的文档和示例。