GeniePath-pytorch 项目使用教程

GeniePath-pytorch 项目使用教程

GeniePath-pytorch项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gen/GeniePath-pytorch

1. 项目的目录结构及介绍

GeniePath-pytorch/
├── doc/
│   └── gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── model_gat.py
├── model_geniepath.py
├── ppi_gat.py
├── ppi_geniepath.py
├── requirements.txt

• doc/: 文档目录，包含 .gitignore 文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• model_gat.py: GAT 模型文件。
• model_geniepath.py: GeniePath 模型文件。
• ppi_gat.py: GAT 模型在 PPI 数据集上的应用文件。
• ppi_geniepath.py: GeniePath 模型在 PPI 数据集上的应用文件。
• requirements.txt: 项目依赖文件。

2. 项目的启动文件介绍

ppi_geniepath.py

该文件是 GeniePath 模型在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络上的应用启动文件。通过运行该文件，可以启动 GeniePath 模型进行训练和预测。

# 示例代码
if __name__ == "__main__":
    # 加载数据
    data = load_data()
    # 初始化模型
    model = GeniePath(args)
    # 训练模型
    train(model, data)
    # 评估模型
    evaluate(model, data)

3. 项目的配置文件介绍

requirements.txt

该文件列出了运行该项目所需的所有 Python 依赖包及其版本。通过运行以下命令可以安装所有依赖：

pip install -r requirements.txt

文件内容示例：

torch==1.8.1
torch-geometric==1.7.2
numpy==1.20.3

以上是 GeniePath-pytorch 项目的基本使用教程，涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望对您有所帮助！

GeniePath-pytorch项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gen/GeniePath-pytorch