Torsional Diffusion 项目使用教程

Torsional Diffusion 项目使用教程

torsional-diffusion项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/to/torsional-diffusion

1. 项目的目录结构及介绍

torsional-diffusion/
├── diffusion/
│   ├── __init__.py
│   ├── ...
├── utils/
│   ├── __init__.py
│   ├── ...
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── environment.yml
├── evaluate_confs.py
├── generate_confs.py
├── optimize_confs.py
├── standardize_confs.py
├── test_boltzmann.py
├── train.py

目录结构说明

• diffusion/: 包含与扩散过程相关的核心代码。
• utils/: 包含项目中使用的各种工具函数。
• .gitignore: 指定Git版本控制系统忽略的文件和目录。
• LICENSE: 项目的许可证文件。
• README.md: 项目的基本介绍和使用说明。
• environment.yml: 用于创建Conda环境的配置文件。
• evaluate_confs.py: 用于评估分子构象的脚本。
• generate_confs.py: 用于生成分子构象的脚本。
• optimize_confs.py: 用于优化分子构象的脚本。
• standardize_confs.py: 用于标准化分子构象的脚本。
• test_boltzmann.py: 用于测试Boltzmann分布的脚本。
• train.py: 用于训练模型的脚本。

2. 项目的启动文件介绍

train.py

train.py 是项目的主要启动文件，用于训练分子构象生成模型。可以通过以下命令启动训练：

python train.py

generate_confs.py

generate_confs.py 用于生成分子构象。可以通过以下命令启动生成过程：

python generate_confs.py

evaluate_confs.py

evaluate_confs.py 用于评估生成的分子构象的质量。可以通过以下命令启动评估过程：

python evaluate_confs.py

3. 项目的配置文件介绍

environment.yml

environment.yml 是用于创建Conda环境的配置文件。可以通过以下命令创建环境：

conda env create -f environment.yml

README.md

README.md 文件包含了项目的基本介绍、安装步骤、使用说明和常见问题解答。在开始使用项目之前，建议仔细阅读该文件。

LICENSE

LICENSE 文件包含了项目的许可证信息，说明了项目的使用和分发条件。

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以上是 Torsional Diffusion 项目的基本使用教程，希望对您有所帮助。如果有任何问题，请参考项目的 GitHub 页面 或联系项目维护者。

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