Clair 项目教程

Clair 项目教程

Clair Clair: Exploring the limit of using deep neural network on pileup data for germline variant calling 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cla/Clair

1. 项目的目录结构及介绍

Clair 项目的目录结构如下：

Clair/
├── cmd/
│   ├── clair-error/
│   └── ...
├── config/
│   ├── config.yaml.sample
│   └── ...
├── contrib/
├── etc/
├── health/
├── httptransport/
├── indexer/
├── initialize/
├── internal/
├── introspection/
├── local-dev/
├── matcher/
├── middleware/
├── notifier/
├── CHANGELOG.md
├── CODEOWNERS
├── DCO
├── Dockerfile
├── LICENSE
├── Makefile
├── NOTICE
├── README.md
├── ROADMAP.md
├── book.toml
├── code-of-conduct.md
├── config.yaml.sample
├── docker-compose.yaml
├── go.mod
├── go.sum
├── openapi.yaml
└── ...

目录结构介绍

• cmd/: 包含 Clair 项目的命令行工具和入口文件。
  • clair-error/: 处理 Clair 错误的相关代码。
• config/: 包含 Clair 项目的配置文件。
  • config.yaml.sample: 配置文件的示例。
• contrib/: 包含 Clair 项目的贡献代码。
• etc/: 包含 Clair 项目的额外配置文件。
• health/: 包含 Clair 项目的健康检查相关代码。
• httptransport/: 包含 Clair 项目的 HTTP 传输相关代码。
• indexer/: 包含 Clair 项目的索引相关代码。
• initialize/: 包含 Clair 项目的初始化相关代码。
• internal/: 包含 Clair 项目的内部代码。
• introspection/: 包含 Clair 项目的自省相关代码。
• local-dev/: 包含 Clair 项目的本地开发相关代码。
• matcher/: 包含 Clair 项目的匹配相关代码。
• middleware/: 包含 Clair 项目的中介件相关代码。
• notifier/: 包含 Clair 项目的通知相关代码。
• CHANGELOG.md: 项目的变更日志。
• CODEOWNERS: 项目的代码所有者文件。
• DCO: 项目的开发者证书文件。
• Dockerfile: 项目的 Dockerfile 文件。
• LICENSE: 项目的许可证文件。
• Makefile: 项目的 Makefile 文件。
• NOTICE: 项目的通知文件。
• README.md: 项目的 README 文件。
• ROADMAP.md: 项目的路线图文件。
• book.toml: 项目的书籍配置文件。
• code-of-conduct.md: 项目的代码行为规范文件。
• config.yaml.sample: 项目的配置文件示例。
• docker-compose.yaml: 项目的 Docker Compose 文件。
• go.mod: 项目的 Go 模块文件。
• go.sum: 项目的 Go 模块校验文件。
• openapi.yaml: 项目的 OpenAPI 规范文件。

2. 项目的启动文件介绍

Clair 项目的启动文件主要位于 cmd/ 目录下。以下是主要的启动文件：

• cmd/clair-error/main.go: 这是 Clair 项目的错误处理入口文件。它负责启动 Clair 的错误处理服务。

启动文件介绍

• main.go: 这是 Clair 项目的入口文件，负责初始化配置、启动服务和处理错误。

3. 项目的配置文件介绍

Clair 项目的配置文件主要位于 config/ 目录下。以下是主要的配置文件：

• config.yaml.sample: 这是 Clair 项目的配置文件示例。它包含了 Clair 运行所需的所有配置选项。

配置文件介绍

• config.yaml.sample: 该文件包含了 Clair 项目的所有配置选项，如数据库连接、日志级别、API 端点等。用户可以根据需要修改该文件以适应不同的运行环境。

# 示例配置文件
database:
  url: "postgres://user:password@localhost:5432/clair?sslmode=disable"
log:
  level: "info"
api:
  endpoint: "http://localhost:6060"

以上是 Clair 项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用 Clair 项目。

Clair Clair: Exploring the limit of using deep neural network on pileup data for germline variant calling 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cla/Clair