PyTorch Geometric Temporal 使用教程
项目介绍
PyTorch Geometric Temporal 是一个基于 PyTorch Geometric 的时序图神经网络扩展库。它构建在开源的深度学习和图处理库之上,提供了最先进的深度学习和参数学习方法来处理时空信号。该库是第一个用于几何结构上时序深度学习的开源库,提供了在动态和静态图上的常数时间差图神经网络。
项目快速启动
安装
首先,确保你已经安装了 PyTorch。然后,你可以通过 pip 安装 PyTorch Geometric Temporal:
pip install torch-geometric-temporal
示例代码
以下是一个简单的示例代码,展示了如何使用 PyTorch Geometric Temporal 进行时序图数据处理:
import torch
from torch_geometric_temporal.dataset import ChickenpoxDatasetLoader
from torch_geometric_temporal.signal import temporal_signal_split
# 加载数据集
loader = ChickenpoxDatasetLoader()
dataset = loader.get_dataset()
# 分割训练和测试数据
train_dataset, test_dataset = temporal_signal_split(dataset, train_ratio=0.8)
# 定义一个简单的图神经网络模型
class GCN(torch.nn.Module):
def __init__(self, in_channels, out_channels):
super(GCN, self).__init__()
self.conv1 = GCNConv(in_channels, out_channels)
def forward(self, x, edge_index):
x = self.conv1(x, edge_index)
return x
# 初始化模型
model = GCN(dataset.num_features, dataset.num_classes)
# 定义损失函数和优化器
criterion = torch.nn.MSELoss()
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01)
# 训练模型
for epoch in range(200):
model.train()
optimizer.zero_grad()
for time, snapshot in enumerate(train_dataset):
y_hat = model(snapshot.x, snapshot.edge_index)
loss = criterion(y_hat, snapshot.y)
loss.backward()
optimizer.step()
if epoch % 20 == 0:
print(f'Epoch: {epoch}, Loss: {loss.item()}')
应用案例和最佳实践
流行病学预测案例
PyTorch Geometric Temporal 提供了详细的案例研究教程,涵盖了 PyTorch Geometric Temporal 功能的各个方面。例如,增量训练在流行病学预测中的应用:
from torch_geometric_temporal.dataset import ChickenpoxDatasetLoader
from torch_geometric_temporal.signal import temporal_signal_split
loader = ChickenpoxDatasetLoader()
dataset = loader.get_dataset()
train_dataset, test_dataset = temporal_signal_split(dataset, train_ratio=0.8)
# 使用预定义的模型进行训练和预测
网页流量管理案例
另一个案例是累积训练在网页流量管理中的应用:
from torch_geometric_temporal.dataset import WikiMathsDatasetLoader
from torch_geometric_temporal.signal import temporal_signal_split
loader = WikiMathsDatasetLoader()
dataset = loader.get_dataset()
train_dataset, test_dataset = temporal_signal_split(dataset, train_ratio=0.8)
# 使用预定义的模型进行训练和预测
典型生态项目
PyTorch Geometric Temporal 与其他开源项目如 PyTorch Lightning 接口良好,允许在 CPU、单 GPU 和多 GPU 上进行训练。以下是一些典型的生态项目:
- PyTorch Lightning: 用于简化深度学习模型的训练和部署。
- DGL (Deep Graph Library): 另一个流行的图神经网络库,与 PyTorch Geometric Temporal 可以结合使用。
通过这些生态项目,用户可以更高效地开发和部署复杂的时空图神经网络模型。