RELION 项目推荐

RELION 项目推荐

relion 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/re/relion

1. 项目基础介绍和主要编程语言

RELION（REgularised LIkelihood OptimisatioN）是一个用于冷冻电子显微镜（cryo-electron microscopy, cryo-EM）图像处理的独立计算机程序。该项目由Sjors Scheres领导的MRC分子生物学实验室开发。RELION主要使用C++编程语言，同时也包含部分Cuda和C代码，以及少量的Python、CMake和HTML代码。

2. 项目核心功能

RELION的核心功能是通过最大后验概率（Maximum A Posteriori, MAP）优化方法，对三维重构或二维类平均进行精细调整。它特别适用于处理冷冻电子显微镜数据，能够有效地提高图像分辨率和结构精度。RELION还支持多种图像处理任务，包括但不限于：

• 三维重构和二维类平均的优化
• 图像的正则化处理
• 最大似然估计
• 支持MPI并行计算
• 提供图形用户界面（GUI）

3. 项目最近更新的功能

RELION项目持续更新，最近的主要更新包括：

• RELION 4.0.x：引入了最新的开发版本，包含更多功能和改进，尽管这些更新尚未经过全面测试，不推荐在生产环境中使用。
• Class Ranker：默认模型已经使用Python 3.9.12、Pytorch 1.10.0和Numpy 1.20.0进行了训练和测试。用户可以根据自己的数据重新训练模型。
• 安装和编译改进：简化了通过cmake进行安装的流程，支持Debian/Ubuntu和RedHat-like系统，并提供了详细的依赖安装指南。
• 错误修复和性能优化：针对FLTK和FFTW相关错误提供了新的编译选项，确保了更好的兼容性和性能。

通过这些更新，RELION继续保持在冷冻电子显微镜图像处理领域的领先地位，为用户提供了更强大和灵活的工具。

relion 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/re/relion