09年第六期螺旋讲堂：SCI论文写作与发表的经验与技巧

       写作及发表SCI论文，是许多作者非常感兴趣的话题。而关于如何写作及发表SCI论文，相信各种版本的“宝典”不计其数。本人从事科研多年，发表和参与发表的SCI文章有150多篇，因而，对如何撰写SCI论文略有体会和心得。尤其在过去五年里，我在修改作者送给美捷登公司服务的论文文稿和在丁香园网站回复“战友”的帖子和私人短信中，也积累了许多撰写SCI论文的知识和经验。在此，本人愿将这些体会、心得、知识和经验总结出来与大家分享，希望对有志于发表SCI论文的“螺友”有所帮助。
本文所涉及的技术要点主要来源于相关文献、网络和书籍，仅供大家参考，同时也请下载者不要传播尤其是以商业为目的的复制、传播等等；如有转载、传播请注明来源于“螺旋网”。若本文侵犯了您的版权或有任何不妥，请Email：helixneter@sina.com 告知。

       美捷登生物科技有限公司是一家在香港注册、旨在帮助生物医学基础研究人员和临床医生将其科研成果尽快尽美地发表在英文生物医学杂志上而提供相应服务的公司。首先，美捷登谨借螺旋网两周岁生日及周年庆活动向螺旋网表示衷心祝贺，愿螺旋网在各级管理人员及各版版主的精心管理下，在各“螺友”的关怀和支持下越办越好！作为合作单位，美捷登很高兴能利用自身的优势，在螺旋网“螺旋讲堂”主办一期讲座，希望能为更多的国内研究者发表SCI论文、让更多的中国人的研究成果走向世界尽一份薄力。
       本期螺旋讲堂，主要和大家分享SCI写作与发表的一些知识和经验。我们将分三部份进行讲解：SCI论文写作常识，论文写作素材来源，常见问题解答。我们此次讲座内容或浅而易懂、或深入浅出、或举一反三。希望对所有志在发表（尤其初写）SCI的作者有所帮助。如果有“螺友”对SCI写作有更多的问题，可发帖提问，美捷登会在第一时间回复。

第一讲 写作与发表SCI论文必读 第一节        如何撰写SCI论文 (一)        写作论文前需要做的准备 在做课题之前，你一定要去查阅你所做的研究是否有人做过，你的研究领域最近几年的研究进展。要做到对课题的现状心中有数，对课题能否完成胸有成竹。简单重复别人的研究是没有任何价值的，只能白白浪费你的时间。而好高骛远，空中楼阁、闭门造车，也很可能枉费你的时间、精力和经费。 (二)        如何写好SCI论文 通常，SCI杂志 (尤其临床杂志)上的论文格式为文题(Title)、栏外文题(Running title)、摘要(Abstract)、关键词(Keywords)、引言/背景(Introduction/Background))、材料（病人）与/方法（Materials(Patients) and Methods）、结果（Results）、讨论(Discussion)、致谢(Acknowledgements)，和参考文献(References)。也有许多偏基础的杂志将材料与方法放在讨论后面。这样的结构安排虽有“八股文”之嫌，但确实能让论文有条有理，从而方便读者快速查找他们感兴趣的信息。因此，在撰写论文前需要根据你的研究结果和所投杂志的格式来组织你的论文构架，包括方法及结果中各级标题（Headings and Subheadings）。 个人总结： 我的体会是写英文文章其实并不难。 1.        要熟悉你的专业，你的实验方法，要尊重结果，实事求是面对结果，下笔之前多看看文献，尤其国外近期文献。我相信只要是正确试验得来的真实结果都是可以解释的，是可以发表的。 2.        对于初写者，“抄写”不可避免，妙在“抄写”的技巧。同类性质的研究文章，撰写格式大同小异，所以，格式可以“照抄”。常用句型可灵活“抄”用。有些描述性、结论性的句子在读懂的情况下尽量用自己的语言“抄写”和总结。但千万不可照抄未读懂的原句。否则，小者笑话百出，大者断送文章，乃至作者甚至作者老板的前程(绝非耸人听闻之谈！）。 3.        尽量使用你熟悉的词汇。不要故意使用华丽、少用或罕见词汇。这是我澳洲老板教我的——他曾无数次将我的“applied, employed, utilized, adapted”等等改成“used”。 4.        要舍得投入精力和时间。 5.        文章写成后，一定要请导师、老板、共同作者或同事审阅。本人在香港做“老板”时，我要求我所有学生或研究助理（Research assistants，都是国内获得博士学位的医生)撰写文章初稿。无一例外。否则，宁可不发。 6.        要有锲而不舍的精神。相信只要想“嫁人”，终将会找到合适的婆家! 我的指导原则是，从头到尾参与一篇英文文章的撰写及发表全部过程对于任何一名愿意继续从事科研工作的医生或研究生都将终生受益。

第二节        文章写好后，如何投稿 投稿及再投稿策略 1.        知道相关专业杂志的影响因子、出版周期、年发行量对选择目标杂志有一定的帮助。如条件许可，可通过汤森路透 (Thomson Reuters)的ISI Knowledge系统http://admin-apps.isiknowledge.c ... 4FcBh1DJlO2Cm8IGjE6查找所有相关专业被SCI收录的杂志及其影响因子。如果无法登陆上述网站，可以通过其Master Journal List http://scientific.thomson.com/mjl/ 逐一查找。 2.        一定要读所要投稿的杂志的稿约和近期的类似文章，看看你的论文是否符合该杂志要求和范围。 一次被拒并不能说明你论文没有价值。被拒稿的原因很多，论文内容和杂志要求不符（张冠不可李戴），论文质量和杂志等级不符（癞蛤蟆岂可吃天鹅肉），审稿人有眼不识泰山，论文撰写语言不过关等等都可导致论文被拒。拒稿后，你可以根据审稿人的合理建议修改论文，然后投往其他杂志。 第三节        投稿后的结局：编辑决定信 论文投稿后可能得如下几种结果： 接受Accept 有两种情况： 1.        直接接收：即论文投稿后即被接受，无需任何修改。这几乎是不可能的事情，只有极少数作者能享受到这一喜悦。 2.        有条件接受：即论文原则上已被接受，前提是作者需作某些不重要的修改。亦少见。 修改 Revision 大致分三种情况： 1.        小修Minor Revision：论文需要做些修改，但修回后不需要再送给Reviewers审阅。不多见。 2.        大修Major Revision：论文修回后通常要再送给上次的Reviewers审阅。这往往是很好的消息，表明审稿人和主编对你的文章感兴趣。但回复一定要认真仔细，不可掉以轻心。大修后被拒的情况时有发生，多缘于粗心大意。 3.        拒绝但可再投Reject and Resubmit：论文现在状态不能接受，但可以修改后重新再投，要重新经过审稿流程，一般是送交与上一次不同的Reviewers审阅。这尽管不是好消息，但也不能说是坏消息。只要认真按审稿人及主编的要求去补试验或积极回应审稿意见，也有很大的可能被接受。 正确对待审稿意见和退稿.。 SCI杂志的审稿人大多是各个领域的权威学者。审稿惯例是无报酬的。审稿人的工作态度大多极其认真。杂志编辑往往会根据审稿人的意见作出决定。因此，对审稿意见要十分重视，对审稿人要非常尊重。对每一条批评和建议，都要认真分析、回复,并据此修改论文。对自己认为是不正确的审稿意见，要极其慎重和认真地回答，有理有据有节地与审稿人探讨。如何对待被杂志拒绝的论文，常常是作者犯难的问题。 拒绝Reject 拒稿大致有以下三种情况： 1.        “完全拒绝”：主编通常会强烈地表达个人意见，表示不愿再看到该论文，因此，再寄送这类文章是没有意义的。 2.        “可申诉性拒绝”：如果你认为拒绝是因为论文有许多不足但没有致命缺陷或审稿人/编辑误判引起，你可以提交申诉信，并积极修改论文以争取主编给你再审稿的机会。不过，申诉后成功被接受的比率非常低，往往不如修改后改投另一份杂志。 3.        “可再投性拒稿”：论文被拒是因为论文虽包含某些有用的数据和信息，但数据不足构成一篇论文或分析有严重缺陷。对这类论文作者不妨等到有足够的数据或有更合理的分析时，再修改成“新”论文并投给同一杂志。主编通常是会考虑重新受理这类文章的。 值得一提的是，即使论文被该杂志拒绝，并不等于文章没有发表的希望，只能说明这篇文章不适合该杂志而已。 第二讲 论文原著素材来源 在与国内科研人员交流过程中，他们常常问我：“你怎么会有那么多东西写？”今年8月初，我在武汉大学给研究生和年轻医生做了场“一点之见即成文”的讲座。在这里我再稍稍整理一下，供“螺友”参考。 有趣的是，我自从涉足科研领域，就一直从事幽门螺旋杆菌（或幽门螺杆菌）的研究，因此，可说是位名副其实的“螺友”。 下面言归正传，根据自身经历谈谈论文素材来源。 第一节        既定实验的完美结局：有心栽花花盛开 我读博士时的主要课题分两个方面，幽门螺杆菌耐药性和幽门螺杆菌感染“根除治疗”后复发。经过三年的努力，在这两个方面均有斩获。 这些结果应该说是比较理想的，特别是后一课题，结果已足够博士毕业（直到现在，在国外也不一定要发SCI论文才可毕业，但实验结果必须要达到Internal and External Examiners的要求）。所以，我94年博士毕业，论文结果部分在1995-1996年发表。博士期间作的部分试验结果有些在1999年才发表。 第二节        仔细观察试验意外现象：无心插柳柳成荫 幽门螺杆菌很“娇嫩”，只能在微需氧环境下生长。但我无意中发现有些菌株是可以经过“训练”从微需氧到需氧过渡，并在需氧环境下生存和生长的。为此，我做了些验证试验，发了篇短文 Culture of Helicobacter pylori under aerobic conditions on solid media. Xia HX, Keane CT, O'Morain CA. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1994 May;13(5):406-9. PMID: 8070454 [PubMed - indexed for MEDLINE]。这一发现的意义在于从新的角度表明幽门螺杆菌可能通过这种过渡能力在不利环境中生存并感染人群。 这只是我“意外观察、意外收获”的开端。在随后的研究中，我还“无意”发现幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性可在无药传代过程中减弱甚至消失，表明幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性是不稳定的，从而解释为什么人群中幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药率相对幽门螺杆菌对灭滴灵的耐药率低的原因，更提示克拉霉素可以重复使用。这一结果发在杂志J Antimicrob Chemother上Xia HX,, Buckley M, Keane CT, O’Morain CA. Clarithromycin resistance in Helicobacter pylori: prevalence in untreated dyspeptic patients and stability in vitro. J Antimicrob Chemother 1996; 37: 473-481. 第三节        善用“公共”资源：它山之石，可以攻玉 许多医院或科室，尤其大型教学医院，长期积累了大量病案，特别是近10多年电脑使用日益普遍和规范，完整准确收集病案资料已不再困难。事实上，美捷登已帮助很多临床医生发表了根据医院或科室积累的资料而撰写的论文。 这里，我想举三个论文案例。这三篇论文都是本人在香港玛丽医院工作时，经得有关领导和同事同意，利用科室或同事的研究资料而撰写发表的。其中最后一篇是武汉大学夏教授和我利用他在香港大学作访问教授两个月的时间里完成的。 第四节        毕业论文也是论文： 花开堪折直须折 对于现在大多数院校的研究生，尤其博士研究生而言，在毕业之前将研究结果发在SCI杂志上已是必需。因而，这一话题似乎已不值得讨论。但许多年前的研究生，甚至于目前仍有少数院校的研究生（尤其硕士生）毕业并不需SCI论文。因此，我还是想谈谈这方面的经验。我本人在博士毕业时，已发表7篇原著SCI论文。其中大多是我博士课题的结果，组成我博士论文的重要部分。这里暂不赘述。我想谈的是2001年我到武汉大学讲学时，我国内合作者的学生，一位很秀气的女孩拿着她的博士论文（中文）给我看，问我可不可以写成英文发表。我当时鼓励她先试试。后来，她不仅发表了她的第一篇SCI论文（Yang Y, Deng CS, Peng JZ, Wong BC, Lam SK, Xia HH. Effect of Helicobacter pylori on apoptosis and apoptosis related genes in gastric cancer cells. Mol Pathol ( J Clin Pathol) 2003;56:19-24.），还成为我在香港大学的第一个研究助理，目前是美国John Hopkins的高级研究人员。 第五节        副产品也是产品 ：别拿豆包不当干粮 我在爱尔兰博士期间最大的收获莫过于“副”产品了。尤其是微生物方法学方面。第六节        阴性结果也是结果：零不仅仅表示没有 曾有研究人员跟我说：“最近投了篇文章，主要内容是阴性结果，已被N个杂志拒了，除了追问为何结果是阴性(而不是别的文章发表的别的类型细胞系的阳性结果)以外几乎没别的问题(当然还有他们最容易、最拿手的问题： there are several English spelling/grammar mistakes)。” 我认为，阴性结果可能影响了审稿人及编辑的兴趣，但不一定是编辑拒稿的主要原因。拒稿原因可能包括： 1.        课题设计不具新意 2.        结果不多且很肤浅- 3.        有意义的结果已在其他杂志发表 4.        语言问题。但这不是主要问题 5.        审稿人可能不太懂你的专业，不能领会阴性结果的意义 第七节        计划不如变化 澳洲做内镜病人不多，而且，进入课题的病人事先必须签Consent Form，采血必须由注册的有资格的医务人员执行。所以，近三年才收集200多例。而幽门螺杆菌感染阳性率仅在40%左右（国内为60%左右）。我充分利用这些病人的活检标本和血清做了许多工作，发表了些“副产品” 我原本设计的验证实验（genotyping）却因条件所限一直未能开展，为此我感到非常沮丧。然而，当我在分析这些病人的病理报告结果时意外发现，绝大多数幽门螺杆菌感染的病人其胃角黏膜为胃窦型，而未感染的病人胃角黏膜为胃体型。这一发现使我欣喜若狂。因此，我和Prof. Talley决定在不告诉我们的意图的情况下让病理科同事严格按国际公认的“Sydney标准”对所有病例重新阅片。结果，不但证实了我的原来的观察，还显示这一现象与胃萎缩性胃炎、胃肠化生（癌前病变）有关。为此，我“发明”了“Antralization（胃窦化）”这一概念，并发表在Am J Gastroenterol上（Xia HH, Kalantar JS, Talley NJ, Wyatt JM, Adams S, Chueng K, Mitchell HM. Antral-type mucosa in the gastric incisura, body, and fundus (antralization): a link between Helicobacter pylori infection and intestinal metaplasia? Am J Gastroenterol. 2000 Jan;95(1):114-21.） 此后，我完全放弃了原来设计的课题，全力投入在“Antralization”课题之中。 第八节        一个问题的多个方面和不同层次：顺藤摸瓜，循序渐进 “Antralization”这一“课题”成为我进入香港大学医学院的“敲门砖”，近500万港币的基金也由此而得。在随后的几年里，我相继发表了数篇有关论著。 第三讲 SCI论文表常见问题 1. 如何阅读、引用文献 事实上，在试验结果统计完毕后写作之前，应该做些文献检索，同时阅读其摘要，选择与你课题非常接近的文献并尽可能找到全文。下笔前，阅读摘要及初读原文全文，并结合你的实验数据，你就可以拟定你的论文的构思。写完初稿后再阅读相关论文全文，你可以充实你文章（尤其讨论）的内容，甚至改进你的论文的语言质量。毕竟英语不是我们的母语。还有，国外大多学者治学比较严谨，文章的逻辑性比较强。他们知道他们写的是什么（不像国内少数作者写的英文文章不知所云）。所以，他们的文章大有“抄”头。 尽量引用最近的相关文献，尤其是综述性文献。 2 如何选择审稿人 杂志对审稿人的身份要求不是太高的，但审稿人必须是某专业的专家。因此，许多在某专业发过论文的（我指的是英文SCI）的作者都会收到审稿邀请信。你在推荐审稿人时，不必太“挑剔”。如果你推荐的审稿人太忙或者太“牛”，他们根本不会理睬一般杂志的邀请，你的文章审稿过程有可能延误。 建议： 1. 推荐国外发过与你结果、结论相似文章的第一或通讯作者； 2. 推荐你论文中曾引用论文的作者； 3. 推荐你或你老板认识的同专业的教授、副教授(华裔为优先）。在国际有些影响的国内的学者也可以，这些学者在国内不一定是“牛”人，但深受国外学术界尊重。 3. 杂志稿约中提及申请版面费减免事宜 国外大多数英文杂志不收任何费用，（除非有彩色图——文章接受后你可以选择发黑白图而不用交钱）。有战友会问，杂志不收任何费用岂不亏本？ 你放心好了。这些杂志多为某权威性学术机构属下的非盈利性的期刊，这些机构的会员会费往往也包括杂志在内，多数会员也比较踊跃认购杂志（每年几百美金）。这些在国际上顶尖的杂志，许多大学、研究单位及企业（如制药公司）以及科研、学术人员都会订购。由于读者众多，药品广告费收入也很可观。还有每年发表机构学术会议（如年会）摘要的收入。这些杂志的编辑和审稿人大多没有工资，属“义务劳动”换取“学术地位”。 下面是本人如何在两份杂志节省彩图发表费实例： 1.        Journal of Clinical Pathology: 这份杂志不收发表费，但收彩图费（黑白可免费）。 我的文中共有7张彩图，每张收费在150英镑左右（具体忘了）（1英镑=15.2人民币）。 出版社主动来信提出有6张图可以合并成一张，这样就变成两张了。因此，费用从1000镑变成了300镑。 2.         Journal of Infectious Diseases:这份杂志收发表费（每页好像65美元）。同时收彩图费（每张大概250美元）。我有四张彩图（两张原位杂交，两张双染免疫组化），一张黑白（RT-PCR)。其中一张双染免疫组化被编辑选为封面，按规定，可减100美元。同时我选择将两张原位杂交图以黑白图发表。 这样，1000美元彩图发表费变成400美元。