药物设计软件【schrodinger】 all manual
Schrödinger(薛定谔)是药物发现的完整软件包,包括:基于受体和配体结构的诱导契合和柔性对接模式;基于受体结构及配体极性的对接模式;基于受体结构及溶液环境性质的对接模式;组合化学库设计及基于组合库的对接模式;基于配体结构的药物设计,药效团和3D-QSAR;生物分子结构模拟,蛋白、糖、核酸、小肽等;基于靶点的药物设计;ADME性质预测。
Schrodinger是药物发现的完整解决方案:
(一)高通量虚拟筛选:薛定谔软件的虚拟筛选功能在35个CPU的集群上每天可以筛选150万个化合物。提供一站式的设置界面,用户可以定义特定的性质,以便过滤掉不满足性质的化合物;所需模块:Glide, LigPrep, QikProp, Epik, Sitemap, Liaision;
(二)精确对接:针对虚拟筛选后的富集化合物库或者用户自己特定的化合物库,利用薛定谔软件提供的精确对接模式可以考虑以下两种真实环境,得到的精确度结果可以和实验的结果相匹配:
(1)配体小分子对蛋白活性位点结构的诱导(Induced Fit);所需模块:Glide, Prime, Liaison, Sitemap, Epik, MacroModel, LigPrep, QikProp;
(2)蛋白分子诱导配体分子电荷的极化(QPLD)&#x
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最新推荐文章于 2024-05-01 10:45:44 发布