Tensorflow自定义读取文件

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Tensorflow数据读取有三种方式：

• Preloaded data: 预加载数据
• Feeding: Python产生数据，再把数据喂给后端。
• Reading from file: 从文件中直接读取

这三种有读取方式有什么区别呢？ 我们首先要知道TensorFlow(TF)是怎么样工作的。

TF的核心是用C++写的，这样的好处是运行快，缺点是调用不灵活。而Python恰好相反，所以结合两种语言的优势。涉及计算的核心算子和运行框架是用C++写的，并提供API给Python。Python调用这些API，设计训练模型(Graph)，再将设计好的Graph给后端去执行。简而言之，Python的角色是Design，C++是Run。

一、预加载数据：

[python]  view plain  copy

1. import tensorflow as tf  
2. # 设计Graph  
3. x1 = tf.constant([2, 3, 4])  
4. x2 = tf.constant([4, 0, 1])  
5. y = tf.add(x1, x2)  
6. # 打开一个session --> 计算y  
7. with tf.Session() as sess:  
8.     print sess.run(y)  

二、python产生数据，再将数据喂给后端

[python]  view plain  copy

1. import tensorflow as tf  
2. # 设计Graph  
3. x1 = tf.placeholder(tf.int16)  
4. x2 = tf.placeholder(tf.int16)  
5. y = tf.add(x1, x2)  
6. # 用Python产生数据  
7. li1 = [2, 3, 4]  
8. li2 = [4, 0, 1]  
9. # 打开一个session --> 喂数据 --> 计算y  
10. with tf.Session() as sess:  
11.     print sess.run(y, feed_dict={x1: li1, x2: li2})  

说明：在这里x1, x2只是占位符，没有具体的值，那么运行的时候去哪取值呢？这时候就要用到 sess.run() 中的 feed_dict 参数，将Python产生的数据喂给后端，并计算y。
这两种方案的缺点：

1、预加载：将数据直接内嵌到Graph中，再把Graph传入Session中运行。当数据量比较大时，Graph的传输会遇到效率问题。

2、用占位符替代数据，待运行的时候填充数据。

前两种方法很方便，但是遇到大型数据的时候就会很吃力，即使是Feeding，中间环节的增加也是不小的开销，比如数据类型转换等等。最优的方案就是在Graph定义好文件读取的方法，让TF自己去从文件中读取数据，并解码成可使用的样本集。

三、从文件中读取，简单来说就是将数据读取模块的图搭好

1、准备数据，构造三个文件,A.csv,B.csv,C.csv

[python]  view plain  copy

1. $ echo -e "Alpha1,A1\nAlpha2,A2\nAlpha3,A3" > A.csv  
2. $ echo -e "Bee1,B1\nBee2,B2\nBee3,B3" > B.csv  
3. $ echo -e "Sea1,C1\nSea2,C2\nSea3,C3" > C.csv  

2、单个Reader，单个样本

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
4. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
6. # 定义Reader  
7. reader = tf.TextLineReader()  
8. key, value = reader.read(filename_queue)  
9. # 定义Decoder  
10. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
11. #example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
12. # 运行Graph  
13. with tf.Session() as sess:  
14.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器，管理线程  
15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
16.     for i in range(10):  
17.         print example.eval(),label.eval()  
18.     coord.request_stop()  
19.     coord.join(threads)  

说明：这里没有使用tf.train.shuffle_batch，会导致生成的样本和label之间对应不上，乱序了。生成结果如下：

Alpha1 A2
Alpha3 B1
Bee2 B3
Sea1 C2
Sea3 A1
Alpha2 A3
Bee1 B2
Bee3 C1
Sea2 C3
Alpha1 A2

解决方案：用tf.train.shuffle_batch,那么生成的结果就能够对应上。

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
4. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
6. # 定义Reader  
7. reader = tf.TextLineReader()  
8. key, value = reader.read(filename_queue)  
9. # 定义Decoder  
10. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
11. example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
12. # 运行Graph  
13. with tf.Session() as sess:  
14.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器，管理线程  
15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
16.     for i in range(10):  
17.         e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch])  
18.         print e_val,l_val  
19.     coord.request_stop()  
20.     coord.join(threads)  

3、单个Reader,多个样本,主要也是通过 tf.train.shuffle_batch来实现

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
5. reader = tf.TextLineReader()  
6. key, value = reader.read(filename_queue)  
7. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
8. # 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。  
9. #Decoder解后数据会进入这个队列，再批量出队。  
10. # 虽然这里只有一个Reader，但可以设置多线程，相应增加线程数会提高读取速度，但并不是线程越多越好。  
11. example_batch, label_batch = tf.train.batch(  
12.       [example, label], batch_size=5)  
13. with tf.Session() as sess:  
14.     coord = tf.train.Coordinator()  
15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
16.     for i in range(10):  
17.         e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
18.         print e_val,l_val  
19.     coord.request_stop()  
20.     coord.join(threads)  

说明：下面这种写法，提取出来的batch_size个样本，特征和label之间也是不同步的

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
5. reader = tf.TextLineReader()  
6. key, value = reader.read(filename_queue)  
7. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
8. # 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。  
9. #Decoder解后数据会进入这个队列，再批量出队。  
10. # 虽然这里只有一个Reader，但可以设置多线程，相应增加线程数会提高读取速度，但并不是线程越多越好。  
11. example_batch, label_batch = tf.train.batch(  
12.       [example, label], batch_size=5)  
13. with tf.Session() as sess:  
14.     coord = tf.train.Coordinator()  
15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
16.     for i in range(10):  
17.         print example_batch.eval(), label_batch.eval()  
18.     coord.request_stop()  
19.     coord.join(threads)  

说明：输出结果如下：可以看出feature和label之间是不对应的

['Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2'] ['B3' 'C1' 'C2' 'C3' 'A1']
['Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3'] ['C1' 'C2' 'C3' 'A1' 'A2']
['Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3' 'Sea1'] ['C2' 'C3' 'A1' 'A2' 'A3']

4、多个reader，多个样本

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
5. reader = tf.TextLineReader()  
6. key, value = reader.read(filename_queue)  
7. record_defaults = [['null'], ['null']]  
8. #定义了多种解码器,每个解码器跟一个reader相连  
9. example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults)  
10.                   for _ in range(2)]  # Reader设置为2  
11. # 使用tf.train.batch_join()，可以使用多个reader，并行读取数据。每个Reader使用一个线程。  
12. example_batch, label_batch = tf.train.batch_join(  
13.       example_list, batch_size=5)  
14. with tf.Session() as sess:  
15.     coord = tf.train.Coordinator()  
16.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
17.     for i in range(10):  
18.         e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
19.         print e_val,l_val  
20.     coord.request_stop()  
21.     coord.join(threads)  

tf.train.batch 与 tf.train.shuffle_batch 函数 是单个Reader读取 ，但是可以多线程。 tf.train.batch_join 与 tf.train.shuffle_batch_join 可设置 多Reader读取，每个Reader使用一个线程 。至于两种方法的效率，单Reader时，2个线程就达到了速度的极限。多Reader时，2个Reader就达到了极限。所以并不是线程越多越快，甚至更多的线程反而会使效率下降。

5、迭代控制，设置epoch参数，指定我们的样本在训练的时候只能被用多少轮

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
4. #num_epoch: 设置迭代数  
5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False,num_epochs=3)  
6. reader = tf.TextLineReader()  
7. key, value = reader.read(filename_queue)  
8. record_defaults = [['null'], ['null']]  
9. #定义了多种解码器,每个解码器跟一个reader相连  
10. example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults)  
11.                   for _ in range(2)]  # Reader设置为2  
12. # 使用tf.train.batch_join()，可以使用多个reader，并行读取数据。每个Reader使用一个线程。  
13. example_batch, label_batch = tf.train.batch_join(  
14.       example_list, batch_size=1)  
15. #初始化本地变量  
16. init_local_op = tf.initialize_local_variables()  
17. with tf.Session() as sess:  
18.     sess.run(init_local_op)  
19.     coord = tf.train.Coordinator()  
20.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
21.     try:  
22.         while not coord.should_stop():  
23.             e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
24.             print e_val,l_val  
25.     except tf.errors.OutOfRangeError:  
26.             print('Epochs Complete!')  
27.     finally:  
28.             coord.request_stop()  
29.     coord.join(threads)  
30.     coord.request_stop()  
31.     coord.join(threads)  

在迭代控制中，记得添加 tf.initialize_local_variables() ，官网教程没有说明，但是如果不初始化，运行就会报错。

=========================================================================================对于传统的机器学习而言，比方说分类问题，[x1 x2 x3]是feature。对于二分类问题,label经过one-hot编码之后就会是[0,1]或者[1,0]。一般情况下，我们会考虑将数据组织在csv文件中,一行代表一个sample。然后使用队列的方式去读取数据

说明：对于该数据,前三列代表的是feature，因为是分类问题,后两列就是经过one-hot编码之后得到的label

使用队列读取该csv文件的代码如下：

[python]  view plain  copy

1. #-*- coding:utf-8 -*-  
2. import tensorflow as tf  
3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
4. filenames = ['A.csv']  
5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
6. # 定义Reader  
7. reader = tf.TextLineReader()  
8. key, value = reader.read(filename_queue)  
9. # 定义Decoder  
10. record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]]  
11. col1, col2, col3, col4, col5 = tf.decode_csv(value,record_defaults=record_defaults)  
12. features = tf.pack([col1, col2, col3])  
13. label = tf.pack([col4,col5])  
14. example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([features,label], batch_size=2, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
15. # 运行Graph  
16. with tf.Session() as sess:  
17.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器，管理线程  
18.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
19.     for i in range(10):  
20.         e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch])  
21.         print e_val,l_val  
22.     coord.request_stop()  
23.     coord.join(threads)  

输出结果如下：

说明：

record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]]

代表解析的模板,每个样本有5列，在数据中是默认用‘，’隔开的，然后解析的标准是[1]，也即每一列的数值都解析为整型。[1.0]就是解析为浮点，['null']解析为string类型