XNAT神经影像多中心数据管理开源平台vagrant虚拟机部署方案

XNAT( extensible Neuroimaging Archive Toolkit )是一个开源的软件平台，旨在帮助神经影像及其相关数据的管理和挖掘。XNAT包括一个加密的后端数据库和一个基于万维网的丰富的人机界面（XND）。

XNAT项目由华盛顿大学、哈佛大学、哈佛大学胡格斯医学院（ Howard Hughes Medical Institute）和生物医学信息技术研究组织（ Biomedical Informatics Research Network）共同提供帮助和支持。

项目网址: https://www.xnat.org/

安装要求:

这里介绍的是在vagrant虚拟机上快速部署xnat的方法. 要求预装 vagrant (>1.8.7) , Git, VirtualBox(>5.1)

XNAT的安装

xnat有很多版本, 例如dev版本, release版本等. 这里默认安装的是release版本.

典型安装(快速安装方法,采用默认的虚拟机系统配置.)

xnat提供了一行命令快速安装方式, 具体命令如下:

git clone --branch master https://bitbucket.org/xnatdev/xnat-vagrant.git && cd xnat-vagrant && ./run xnat setup

快速安装采用了默认的环境设置. 虚拟机网络IP是10.1.1.17, 内存2G. 安装过程中会在shell中打印出具体的过程,安装成功后会在shell控制台上打印出默认参数具体如下:

    xnat-release: #
    xnat-r