核磁数据处理之配准标准模板

最新推荐文章于 2024-02-29 11:19:50 发布
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分类专栏： MRI data 文章标签： 核磁 FSL
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说到registration,就必须要首先介绍一下模板.由于人脑存在个体差异, 扫描时候的图像在空间中的坐标也不同, 研究时必须要首先消除个体差异,统一坐标, 也就是需要将被试人员的大脑全部”订正/配准”到标准模板上, 这样后续才能进行统计分析.
目前国际上最广泛使用的标准模板是MNI152. MNI是加拿大的蒙特利尔神经科学研究中心 “Montreal Neurosciences Institute”的缩写. MNI152采用了152个健康人的152 3D T1数据加权平均得到. 根据平均算法不同, 分为线性linear和非线性nonlinear两种.
图 human brain template
上图来自: http://nist.mni.mcgill.ca/?page_id=714. 其中152 nonlinear 6th generation是指在加权平均之前,先用高维非线性配准过的MNI152模板.

MNI305是MNI152的前身, 顾名思义来自305个健康人的MRI扫描图像. 脑成像国际联盟(The international consortium for brain mapping ，ICBM）采用了MNI305 作为他们的模板, 这就是后续的SMP99标准模板. 脑成像国际联盟推荐的另外一个模板是ICBM152, 在神经成像研究中，大部分研究者均采用该模板作为大脑模板。

随后，脑成像国际联盟ICBM又推出一个更具有代表性的模板：ICBM452，将452个人

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lxy_Alex
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MNI152 坐标空间和 fsaverage 坐标空间相互转换， 如已知fsaverage空间的坐标如何求MNI152 坐标？aparc.a2009s.annot转化到MNI152空间？
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
11-13 1767
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02-29 515
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YYY7的博客
09-12 1312
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learner_jj的博客
12-25 448
采用FSL软件生成基于目标靶点的目标靶区文件
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05-21 9593
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weixin_42338058的博客
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Neuromaps: 大脑结构和功能的图解
cc1609130201的博客
10-13 1109
在箱线图中，箱体的两端代表零模型分布的第一（25%）和第三（75%）四分位数，中心线（中位数）代表零模型分布的第二四分位数（n = 1,000旋转），线的延伸部分代表分布的非异常范围，而开放的圆圈代表异常值。其中一些图谱最初是在不再使用的坐标系统中定义的。例如，功能梯度与国家卫生研究院（NIH）的等距缩放在CIVET 41k空间中显著相关（r = 0.223，双侧Pspin = 0.049），但在fsLR 32k空间中的相关性不显著（r = 0.217，双侧Pspin = 0.097）（图5c）。
图论模板整理
Colin_27的专栏
07-15 1278
大部分来自LRJ //无向图求割点 int pre[maxn], low[maxn], dfs_clock; vector G[maxn]; int iscut[maxn]; int dfs(int u, int fa) //求出所有点i是否为割点iscut[i] { int lowu = pre[u] = ++dfs_clock; int child = 0;
模板配准 matlab
12-24
模板配准是一种在医学影像处理和计算机视觉领域广泛应用的技术，它可以用来将一个图像的特征对齐到另一个图像，以便进行比较和分析。在MATLAB中，我们可以使用Image Processing Toolbox中的一些函数来实现模板配准。 首先，我们可以使用imregister函数来注册两幅图像。这个函数可以根据两幅图像的特征来进行配准，可以选择不同的配准算法，如互相关配准、仿射配准或弹性配准。通过调整配准算法的参数，可以得到不同的配准效果。 其次，我们可以使用imwarp函数来对图像进行变换。通过将一个图像的变换矩阵应用到另一个图像上，可以实现两幅图像的配准对齐。这个函数可以通过提供变换矩阵来对图像进行平移、旋转、缩放或者其它自定义的变换操作，来实现图像的配准。 除了这些函数，MATLAB还提供了一些图像配准的工具箱，如图像配准工具箱，可以帮助我们更方便地进行模板配准操作。在使用MATLAB进行模板配准时，我们可以根据具体的图像和需求选择合适的方法和工具，来实现图像的配准和对齐。同时，也可以通过编写自定义的配准算法或者工具函数来实现更复杂的配准操作。 总之，MATLAB提供了丰富的图像处理函数和工具，可以帮助我们实现图像的模板配准操作，从而更好地应用于医学影像处理、计算机视觉和其它领域的应用中。
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