生物信息处理一些经过人工输入的数据,往往有少量的错误。但是这些元数据往往要与结果数据统一分析,且非常之重要。数据量小,那就一个一个改吧,如果太多了,杯具了, 怎么办?
工作需要写了一个python小函数,用fuzzywuzzy模糊匹配技巧解决人工数据和标准数据的匹配问题。基本原理是先精确匹配,如果没有,采用模糊匹配遍历目标空间,选取打分最大的提交用户检查,最后输出结果。
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fuzzywuzzy: fuzzywuzzy 0.16.0
这里用了fuzzy.ratio,大家也可以根据需要选其它的,参看文档。