用Python模糊匹配处理人工数据的匹配

生物信息处理一些经过人工输入的数据,往往有少量的错误。但是这些元数据往往要与结果数据统一分析,且非常之重要。数据量小,那就一个一个改吧,如果太多了,杯具了, 怎么办?

工作需要写了一个python小函数,用fuzzywuzzy模糊匹配技巧解决人工数据和标准数据的匹配问题。基本原理是先精确匹配,如果没有,采用模糊匹配遍历目标空间,选取打分最大的提交用户检查,最后输出结果。

分享给大家,也许有用。

fuzzywuzzy: fuzzywuzzy 0.16.0

这里用了fuzzy.ratio,大家也可以根据需要选其它的,参看文档。
在这里插入图片描述在这里插入图片描述

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