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原创 Affymetrix芯片分析:获取差异表达基因系列一
实验思路:程序代码及运行结果:library(affy)%把affy包载入R中library(tcltk)%把tcltk包载入R中filters matrix(c("CEL file", ".[Cc][Ee][Ll]", "All", ".*"), ncol = 2,byrow = T)%生成2*2字符矩阵,用来定义选择文件类型
2015-04-13 22:36:51 8173
原创 Affymetrix芯片分析:获取差异表达基因系列三_SAM
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("ArrayExpress")library(ArrayExpress)AEsetGEO中哮喘相关的基因表达谱数据(编号GSE470) save(AEset,file="AEset.RData")load("AEset.RData")clas
2015-04-13 11:09:58 2516
原创 Affymetrix芯片分析:获取差异表达基因系列二_Moderated t statistic
library(limma)%把limma包载入R中library(tcltk)%把tcltk包载入R中library(affy)%把affy包载入R包中filters cel.files data.raw design colnames(design) eset.rma eset
2015-04-13 11:05:17 2517
空空如也
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