数据预处理——以GSE3494为例

1、数据读取

1）读取excel文件——GEO中Series Matrix File(s)是预处理过的基因表达矩阵，用excel打开删掉注释信息，获得行为探针，列为样本的基因表达矩阵。

read.table(),read.csv(),read.delim()直接读取EXCEl文件时，都会遇到一下问题：“在读取‘.xls’的TableHeader时遇到不完全的最后一行”。

解决的方法有以下几种：假如文件1.1中是一个6乘以2的矩阵，元素为：

             

1	23
2	24
3	25
4	26
5