用pandas读取大文件

当遇到上GB的大CSV文件时,直接用pandas.read_csv可能会导致MemoryError。通过设置read_csv的chunksize参数,可以分块读取并处理文件。这允许在内存限制下进行数据清洗。示例代码展示了如何以迭代器方式读取大文件的前几行,以便初步了解数据。
摘要由CSDN通过智能技术生成

读取上GB大文件的方式有很多,但是并不是都有像pandas这样强大的数据清洗功能。数据太大是,可以分块处理,及时手动删除内存,最后在合并数据。

 

今天在读取一个超大csv文件的时候,遇到困难:

  • 首先使用office打不开
  • 然后在python中使用基本的pandas.read_csv打开文件时:MemoryError
  • 最后查阅read_csv文档发现可以分块读取。
  • read_csv中有个参数chunksize,通过指定一个chunksize分块大小来读取文件,返回的是一个可迭代的对象TextFileReader,IO Tools 举例如下:
In [138]: reader = pd.read_table('tmp.sv', sep='|', chunksize=4)

In [139]: reader
Out[139]: <pandas.io.parsers.TextFileReader at 0x120d2f290>

In [140]: for chunk in reader:
   .....:     print(chunk)
   .....: 
   Unnamed: 0         0         1         2     
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