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原创 mailstone1for 0125

19年1月23日记录,转眼间,差两天来深圳就到第十年了,为了一个更强大的自己,记录一下这个时刻

2019-01-23 17:39:20

阅读数 267

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原创 mount.nfs: Stale file handle的问题解决办法

mount.nfs: Stale file handle的问题解决办法 最近集群出现磁盘突然掉的问题,按照其他高手的方法解决,有三种方法 umount -f /directory fuser –k /path 3:暂缺 按照网络上给的方法处理,发现umount 之后可能会出现 umo...

2018-10-11 13:16:51

阅读数 5261

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原创 SGE维护中的一些小问题

1:安装包下载 https://arc.liv.ac.uk/trac/SGE/ 2:sge_shepherd won’t run – dynamic library missing? 有博主提到需要删掉yum的f /etc/yum.repos.d/*,其实根本用不到,可以到gridengin...

2018-08-24 11:01:40

阅读数 367

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原创 centOS7 安装sun javajdk删除OPENJDK

1:删除系统openjdk 通过 rpm -qa | grep java查看JDK相关的包, 然后通过命令删除下面三个相关的包: rpm -e –nodeps java-1.7.0-openjdk-1.7.0.75-2.5.4.2.el7_0.x86_64 rpm -e –nodeps j...

2018-07-16 10:05:11

阅读数 100

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原创 pip 安装

最近新买了一些服务器,需要安装python,以前都是直接下载安装包,比较麻烦,现在发现一个比较方便的方法,特别记录一下,不知道怎么安装包的可参考1中链接自己去找,其实也可以看pip的help 以下是Pip安装过程 curl “https://bootstrap.pypa.io/get-pip....

2018-01-13 16:08:59

阅读数 192

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原创 centOS7 无法ping

systemctl disable NetworkManager systemctl enable network centOS7重启后无法联网,但是也没有办法用service network restart的命令找了很久发现用上面的命令可以,这一点和以前的版本不一样http://serv...

2016-07-06 16:10:05

阅读数 5517

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原创 生产环境中centOS7最简版安装

与生产环境中,centOS最好采用最简版,如果需要其他功能可以根据需求安装,最近读到一篇文章,提到安装最简版后要做的30件事情,故依次记之,上一篇文章提到centOS6.5升级到centOS7,后来发现问题多多,所以就索性直接安装一下centOS7系统, 1:u盘安装centOS7系统2:安装完...

2016-03-23 09:32:29

阅读数 4308

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原创 centOS6.5升级到ceontOS7

过年这几天在家里没事,就升级一下服务器,当时安装的系统环境是centOS6.5,最近随着软件的升级,发现很多软件都没发安装了,只有升级系统才好,网上找了一下教程 比较好的如linux公社上的一篇文章[1],基本上按照上面的安装就好了,各安装博客介绍的内容之间也是大同小异,最近redhat实现了在...

2016-02-14 15:46:29

阅读数 532

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原创 博客一周年and来深圳6年整

今天正好是CSDN博客一周年了,也是鄙人到深圳6年整,时间说长不长,说短不短,纪念一下

2016-01-26 19:47:45

阅读数 300

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原创 centOS集群repeatmarker软件安装

1. 安装RMBlast序列搜索引擎repeatmasker安装的时候需要安装g++,如果直接输入 yum install g++ 会提示 No package g++ available. Error: Nothing to do 查了一下[1],在centOS系统上,g++的...

2016-01-15 14:34:09

阅读数 936

评论数 1

原创 RCurl在linux安装问题

RCurl在linux上安装会报错安装不成功, 可从curl官网下载源程序包来解决问题

2015-12-08 17:16:15

阅读数 2479

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翻译 TensorFlow:谷歌机器学习白皮书翻译(1)

TensorFlow: Large-Scale Machine Learning on Heterogeneous Distributed Systems基于多样分布系统的大规模机器学习 (heterogeneous这里翻译成多样的,可能不准确,欢迎大家指正)TensorFlow [1] is ...

2015-11-25 23:42:30

阅读数 4944

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原创 gcc在window系统环境下的安装

MinGW是指只用自由软件来生成纯粹的Win32可执行文件的编译环境,它是Minimalist GNU on Windows的略称。   实际上 MinGW 并不是一个 单纯的C/C++ 编译器,而是一套 GNU 工具集合。除开 GCC 以外,MinGW 还包含有一些其他的 GNU ...

2015-11-25 21:19:27

阅读数 365

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原创 centOS安装scipy

前几个月安装python包的numpy和scipy一直不成功,今天把服务器联网,用pip试着安装一下,发现用pip install numpy可以成功 安装pip install scipy,报错,说是blas包没有安装,上网找一下,有ancy网友的帖子说[1]利用yum 安装相应的几个包就行了...

2015-10-20 10:40:15

阅读数 1772

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原创 关于ggplot改变背景报错的问题

今天打算画一个barplot,然后加上方差,后来想要把背景去掉,加上theme主题,结果发现总会报错,Error in inherits(x, “theme”) : argument “e2” is missing, with no default 搞了两个小时,终于发现错误的原因并不是网页上说...

2015-09-07 18:05:19

阅读数 3115

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原创 R语言饼图的绘制

提供了R语言和ggplot2画pie图的方法,并解决了网上博文留下的小胡子的问题

2015-08-04 16:10:04

阅读数 5464

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原创 若干点连接成平滑曲线

最近做折线图,想把几个点平滑处理,以前做过,但是不记得怎么搞了,在网上查一下,发现有人已经给出来代码了,具体如下:a<-c(35293 , 61916 , 36557 , 26076 , 20800 , 52524 , 83579 ,156257, 478688 ,221...

2015-07-20 16:25:00

阅读数 2296

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原创 bootstrap结合thinkphp编辑网站

bootstrap和thinkphp

2015-06-02 22:36:17

阅读数 1273

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转载 转载R语言实现遗传算法

转自:http://blog.fens.me/algorithm-ga-r/ 在R语言中,有一些现成的第三方包已经实现的遗传算法,我们可以直接进行使用。mcga包,多变量的遗传算法,用于求解多维函数的最小值。 genalg包,多变量的遗传算法,用于求解多维函数的最小值。 rgenoud包,复...

2015-05-29 21:30:35

阅读数 5034

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转载 R语言多元分析

转载自http://www.plob.org/2012/09/19/3465.html http://xccds1977.blogspot.com A. 主成分分析 B. 探索性因子分析 C. 多维标度分析 D. 判别分析 E. 聚类分析 作者从这5个方面...

2015-05-21 13:58:29

阅读数 516

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原创 Rcurl抓取NCBI信息

Rcurl抓取网页信息的教程网上已经给了很多,最经典的当属不务正业之Rcurl【1】,不过最近发现统计之都取消了会员制度,所以也就只能是演习前半部分了,其他资源也有不错的,如aircode的【2】研究的是汽车之家的车型,代码可以跑通,很是不错,但是据说XML包对汉语支持不好,另外其作者还有几篇文章...

2015-05-17 16:13:15

阅读数 2246

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原创 R语言plyr包和dplyr包学习

apply族函数是R语言中很有特色的一类函数,包括了apply、sapply、lapply、tapply、aggregate等等。在这篇博文里对它们进行了简略的说明。这一类函数本质上是将数据进行分割、计算和整合。它们在数据分析的各个阶段都有很好的用处。例如在数据准备阶段,我们可以按某个标准将数据分...

2015-05-15 22:35:40

阅读数 4751

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原创 R+kintr+makdown完成自动化报告

公司有一天突然想到了自动化报告,这个事情就落在了我的身上,花了一个星期查资料,发现业界常用的是LeTeX以及LyX,无比的汗颜,后来又找到yihui大大写的knitr包,发现这个加上markdown还是比较靠谱的一种选择,所以在这里就记录一下如何操作的。 markdown作为一种轻量级语言,自己去...

2015-05-14 16:46:12

阅读数 3459

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原创 R安装ggbiplot在windows下的调试过程以及使用方法

有文章说需要安装上devtools包,发现直接用install.packages("devtools")装上即可 但是在library(devtools)的时候提示: WARNING: Rtools is required to build R packages, but is...

2015-04-24 11:44:19

阅读数 6356

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转载 解决Mysql ERROR 1045 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost'问题

数据库root好久不登录,结果提示 Mysql ERROR 1045 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost' 找了很多博客,发现下面这段是管用的,贴出来,也让小伙伴少走弯路 First t...

2015-04-13 17:44:18

阅读数 3043

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原创 centOS断电重启后无法ping通网关

前天服务器断电,重启后发现无法ping 网关192.168.1.1,觉得可能是重启后网关有问题,就通过route重新看了一下,发现没有问题,但是依旧不管用 所以就重启NetworkManger,   /etc/init.d/NetworkManager  restart, 重启network ...

2015-04-13 09:58:41

阅读数 5758

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原创 相应分析的R包ca和mca,cca,RDA的R实现整理

ade4 :  cca 先列出来几篇文章 豆瓣的几篇博文,大概介绍了一下对应分析的ca包中的ca分析函数和mjca()函数,具体算法和具体参数的意思并没有细说 http://www.douban.com/note/236880884/ http://www.douban.com/note/236...

2015-04-12 19:33:02

阅读数 13339

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原创 路由器LAN1设置好,插上电脑可以用,插上H3C交换机不可以用

昨天公司突然断电,服务器重启了一次,发现思科的路由器坏掉了,所以就回家拿了一个我这边自己的一个路由器换上,但是设置好网络后,发现从LAN1口出来的网线接到电脑上是可以上网的,但是接到H3C上却上不了网,而且ping不通,提示连接超时,只要把线插上就会发现这个问题,而拔掉就正常了,而我把这根线查到电...

2015-04-03 17:49:51

阅读数 1270

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翻译 HISAT,sTRINGTIE,ballgown三款RNA-seq信息分析软件

Bowtie 里的FM-index 简介 原文链接:http://m.blog.csdn.net/blog/stormlovetao/7048481 最近看新发表的几篇RNA-seq比对,组装的软件,发现HISAT里面也用到了FM-index这个算法,所以就找了一下,原博文链接如上所示,说...

2015-04-02 11:35:47

阅读数 10967

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原创 物理版情书

当我的混沌方程的解画了满了整个电脑屏幕 想到你,我今生都没有最终解的美女   根据万有引力定律 当你的引力场大到无穷; 我知道最后剩下的一个奇点只有黑洞; 没有打算今生逃离你的视界; 我知道即使我是光的速度也只能在你的边上留下一片涟漪; 随着未知的原...

2015-03-28 20:59:10

阅读数 1000

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原创 R画corplot

相关性系数是判别两个样品之间相似度的一种度量方式,如果有多个样品,你打算看看他们之间的相似性,比较好的一种办法就是画corplot 这里给出来一个R语言的ggplot版本的方法, install.packages("corrplot") library(corrplot) r...

2015-03-16 10:49:48

阅读数 3183

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原创 R语言t检验,秩和检验,fdr的案例分析

如何用R语言计算t检验,秩和检验和FDR校正

2015-03-03 23:20:47

阅读数 9829

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原创 R语言绘制韦恩图并在图上加线标识

绘制韦恩图常用的软件是VennDiagram包,可以先install.packages("VennDiagram")   【1】 library(VennDiagram) 生成几个集合并计算各个集合及其相互交集的大小: A = 1:150 B = c(121:170,...

2015-02-25 16:30:38

阅读数 4792

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原创 可以ping通外网,ping不通内网,同时可以Ping网关,但是外部ping不到IP

易基因公司内部用的是IBM X系列的服务器,前一段时间公司买了一个固定IP,但是设置好之后发现无法用固定IP外部访问,但是可以ping通网关,后来测试了很多方法,都不管用,今天又来找问题,把内网IP换掉,在服务器上都设置成一个外网的IP,route之后,发现: Kernel IP rout...

2015-02-13 18:45:22

阅读数 10040

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原创 先来占个地方

先来占个地方吧,以后技术类博客将会留着csdn,特此声明 博主研究方向介绍:深圳市易基因科技有限公司合伙人,主要研究方向是生物信息,数据挖掘和机器学习

2015-01-27 11:13:25

阅读数 276

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