单细胞多组学
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单细胞多组学相关知识
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这个作者很懒,什么都没留下…
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同一细胞中染色质可及性和转录组的综合分析
对同一细胞中染色质可及性和转录组的综合分析,有助于了解特定基因组区域的染色质状态与相应转录本水平的直接联系。而且,转录因子的结合是瞬时的,而染色质水平反映的表观遗传标记的变化可以持续数天或数周。目前,科学家们已经开发出多种方法来同时分析染色质和转录组。(通过同一个beads上带的两组不同的barcode组合识别和关联单细胞中的两套数据,该barcode组合约有700k)。从技术方法层面上来讲,目前关于多组学技术中scATAC-seq和scRNA-seq的multiome技术及联合分析应该是相对比较成熟的。原创 2024-08-21 10:41:13 · 195 阅读 · 0 评论 -
什么是多组学整合
通过整合这些不同来源的数据,研究人员能够揭示基因、蛋白质和代谢产物之间的相互作用及其在细胞和组织中的功能。这种方法有助于识别生物标志物,理解疾病机制,推动个性化医学的发展,并提供对生物系统的整体视角,从而提高研究的准确性和深度。生物信息学领域的多组学整合是指结合和分析来自多个生物学层次的数据,以全面理解生物系统的复杂性。数据解释:解释和理解人工智能模型和解决方案的输出和决策,特别是针对深度神经网络等复杂的。多组学数据包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等。原创 2024-08-21 09:22:46 · 281 阅读 · 0 评论 -
单细胞多组学数据整合
'原创 2024-07-09 08:42:39 · 184 阅读 · 0 评论 -
单细胞多组学整合与对齐的计算方法
最近发展起来的生成单细胞基因组数据的技术在生物学领域产生了革命性的影响。多组学测定提供了更大的机会来理解细胞状态和生物过程。然而,整合具有非常不同维度和统计特性的不同组学数据的问题仍然非常具有挑战性。为此任务正在开发越来越多的计算工具,利用了从机器翻译到网络理论的思想,代表着生物学和数据科学交叉口上的又一个前沿。我们在这篇综述中的目标是全面、及时地调查用于整合单细胞多组学数据的计算技术,同时使每种算法背后的概念易于理解,适用于非专业人士。原创 2024-02-26 20:25:08 · 744 阅读 · 0 评论