FSL软件安装

总结一下FSL软件的安装，我装了很久本来想放弃找代装，他要我100，我就自己搞了。

虚拟机的安装不多说，可以找个教程，很多。

第一步：下载FSL软件包（下载的很慢，注意看看文件是不是全的）

网址：http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fsl-6.0.3-centos6_64.tar.gz

我使用的迅雷，没有会员下载的很慢，（PS:我新下载的迅雷所以领了白金会员一天，不到一个小时就下载好了）也可以去找别人下载好了的，我参考的是这篇文章(88条消息) FSL6.0.3/FSL6.0.4完整安装与FSLeyes、imcp、dcm2niix等Not Found修复(centos和ubuntu)_fsleyes界面_涂笔贝塔的博客-CSDN博客一开始以为软件包不对。后来是发现拷贝到虚拟机里的时候出现了问题。

（链接：百度网盘 请输入提取码 提取码：hcbr ）

第二步：将软件包放到虚拟机里（这个地方碰了很多壁，所以仔细讲讲）

我是直接将下载好的压缩包拖动到虚拟机里的。

我一开始使用的u盘传的，但是传进去的压缩包文件不全。（我怀疑可能是是u盘传输速度的问题大家也可以试试硬盘传输。点击虚拟机里面的可移动硬盘就可以连接上u盘硬盘）

 第三步：将文件放在usr/local文件夹下并解压

先到fsl软件包所在的文件夹下：cd /文件路径。

然后使用 

cp fsl-6.0.3-centos6_64.tar.gz /usr/local

命令将文件复制到local路径下（PS：可以使用Tab键补全文件名称）

第四步：解压文件

首先进入到local路径下，使用：

tar -xzvf /opt/fsl-6.0.3-centos6_64.tar.gz

命令解压文件。

如果文件上有个小锁子可以使用：

chmod +777 Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh

命令打开小锁子。

另外解压完之后要去看一看文件是否全，解压过程是否报错。

如果报错或者文件不全（可能会出现只有lib文件夹和一个文件的情况），就获取管理员权限使用：su命令。

解压后的文件包含以下这些：

 第五步：配置环境

打开home文件夹，然后 Ctrl+h 显示隐藏文件，找到.bashrc

或者直接使用命令：

sudo gedit /etc/bash.bashrc

打开文件也一样。

在文件末尾添加

export FSLDIR=/usr/local/fsl
export PATH=$PATH:$FSLDIR/bin
source $FSLDIR/etc/fslconf/fsl.sh

 

PS：我不知道安装在home文件夹下可不可以，我一开始安装在home文件夹下报错的主要原因是因为解压的文件缺失。所以如果想尝试可以试一试。

 第六步：重启终端。输入fsl，就会跳出fsl页面啦