2015-12-31 MPI and Pthread

MPI and Pthread

并行计算

并行可以用openmpi，也可以用mpich，二者应该是并列的。但是由于二者提供了几乎一样的命令，所以二者可以同时安装，但是不可以同时处于使用状态。

openmpi

安装openmpi:

sudo yum install openmpi openmpi-devel

安装后，二进制文件位于 /usr/lib64/openmpi/bin 下，动态库文件位于 /usr/lib64/openmpi/lib 下，因而实际使用的话还需要额外的配置，在 .bashrc 中加入如下语句:

export PATH=/usr/lib64/openmpi/bin/:${PATH}
module load mpi/openmpi-x86_64

PS：要使用 module 命令需要先安装 environment-modules 包。

mpich

安装mpich:

sudo yum install mpich mpich-devel

安装后，二进制文件位于 /usr/lib64/mpich/bin 下，动态库文件位于 /usr/lib64/mpich/lib 下，因而实际使用的话还需要额外的配置，在 .bashrc 中加入如下语句:

export PATH=/usr/lib64/mpich/bin/:${PATH}
module load mpi/mpich-x86_64

Note

只能使用一个，我选择openmpi
C和C++编译命令不同，一个是mpicc，一个是mpicxx

pthread

编译命令
g++ -lrt -lpthread PI.cpp -o PI