生物信息学
ianutin
这个作者很懒,什么都没留下…
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深度学习第一天(01)
随着神经网络技术的发展,在生物信息分析领域引入了深度学习方法首先,什么是神经网络呢?膝跳反射告诉我们:1、不同的神经元,各司其职,它们会接收外界的信息,并且做出反应2、神经元之间会相互交互,而且不总是通过大脑中枢神经来中转信息喝水判断水温是否合适告诉我们:3、神经元,不是对所有外界的消息都会立即反应的,它会存在一个阀值,信息超过了阀值,它才会激活,没有超过阀值,它就处于睡眠状态捡起钞票与对树叶不理不睬告诉我们:4、神经元,不是对外界所有的信息都会做出反..原创 2021-11-22 15:55:22 · 785 阅读 · 0 评论 -
linux脚本中的循环数组更新问题
arr_1=(0)arr_2=(0)echo ${arr_1[*]}sed -i 's/^M//g' datasets_listcat datasets_list|while read line #循环开始doarr=(${line//\\t/})cdna=${arr[1]}cdna1=$(find $cdna|xargs ls -Rd|grep 1.fq.gz)cdna2=$(find $cdna|xargs ls -Rd|grep 2.fq.gz)arr_1=("${arr_1[.原创 2021-11-16 10:32:16 · 724 阅读 · 1 评论 -
Rstudio与python的连接,使用Seurat的runumap函数时的一系列问题
生物信息初学者rstudio中的疑问刚开始接触单细胞测序分析,学习Seurat的基本流程时,到了非线性降维分析这一步时,遇到了诸多的麻烦;在Seurat里会用到RunUMAP()函数,这个函数的应用需要一个python环境的搭建。首先下载了anaconda这个软件,进行虚拟python环境的搭建:1.选择Create,新建一个python环境,默认选择Python版本2.在右侧的菜单里选中not installed,搜索以下的包并一一安装这些包是UMAP的官方文档中要求搭建的Py原创 2021-06-22 19:34:33 · 1272 阅读 · 2 评论