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生物信息学
ianutin
这个作者很懒,什么都没留下…
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深度学习第一天(01)
随着神经网络技术的发展,在生物信息分析领域引入了深度学习方法 首先,什么是神经网络呢? 膝跳反射告诉我们: 1、不同的神经元,各司其职,它们会接收外界的信息,并且做出反应 2、神经元之间会相互交互,而且不总是通过大脑中枢神经来中转信息 喝水判断水温是否合适告诉我们: 3、神经元,不是对所有外界的消息都会立即反应的,它会存在一个阀值,信息超过了阀值,它才会激活,没有超过阀值,它就处于睡眠状态 捡起钞票与对树叶不理不睬告诉我们: 4、神经元,不是对外界所有的信息都会做出反..原创 2021-11-22 15:55:22 · 788 阅读 · 0 评论 -
linux脚本中的循环数组更新问题
arr_1=(0) arr_2=(0) echo ${arr_1[*]} sed -i 's/^M//g' datasets_list cat datasets_list|while read line #循环开始 do arr=(${line//\\t/}) cdna=${arr[1]} cdna1=$(find $cdna|xargs ls -Rd|grep 1.fq.gz) cdna2=$(find $cdna|xargs ls -Rd|grep 2.fq.gz) arr_1=("${arr_1[.原创 2021-11-16 10:32:16 · 730 阅读 · 1 评论 -
Rstudio与python的连接,使用Seurat的runumap函数时的一系列问题
生物信息初学者rstudio中的疑问 刚开始接触单细胞测序分析,学习Seurat的基本流程时,到了非线性降维分析这一步时,遇到了诸多的麻烦; 在Seurat里会用到RunUMAP()函数,这个函数的应用需要一个python环境的搭建。首先下载了anaconda这个软件,进行虚拟python环境的搭建: 1.选择Create,新建一个python环境,默认选择Python版本 2.在右侧的菜单里选中not installed,搜索以下的包并一一安装 这些包是UMAP的官方文档中要求搭建的Py原创 2021-06-22 19:34:33 · 1322 阅读 · 2 评论