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原创 DNA Movie

DNA 

2011-05-25 23:01:50 118

原创 基因的哲学

[b]勤俭节约是美德[/b]相对于真核生物(高等动植物),原核生物(细菌等)表现得非常节俭,这是与他的生存环境分不开的。真核生物生存能力强,有的能够自己选择环境,比如说动物。而原核动物就没有这么好的生存条件了,成天饱一顿饿一顿,运气好时飘到垃圾堆里饱餐一顿,运气不好就饿肚子吧。于是他不得不节俭起来,连对待决定自己遗传和生存的基因也毫不手软,能简则简。基因是由碱基对组成的,每种生物都有4个碱基,...

2011-04-10 23:18:28 421

原创 Blastp/PSI-BLAST/PHI-BLAST

Blastp/PSI-Blast/PHI-BLAST都是蛋白序列与蛋白序列之间的Blast比对。1,Blastp: 标准的蛋白序列与蛋白序列之间的比对Standard protein BLAST is designed for protein searches.Blastp用于确定查询的氨基酸序列在蛋白数据库中找到相似的序列。跟其它的Blast程序一样,目的是要找到相似的区域。2,PSI-...

2011-04-10 23:08:02 3349

原创 生物信息学所用的方法和技术

一、数学统计方法数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如,在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔可夫模型进行基因识别。二、动态规划方法动态规划(Dynamic Programming)是一种通用的优化方法,其基本思想是:在状态空间中,根据目标函数,通过递推,求出一条从状态起点到状态终点的最优路径(代价最小的路径)。动态规划在生物信息学研究中用得最多的方面是DNA序列或...

2011-04-09 23:45:54 1776

原创 SMITH WATERMAN算法

1.1 序列相似性比较生物信息学中,对各种生物大分子序列进行分析是一件非常基本的工作。从序列的片段测定,拼接,基因的表达分析,到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列相似性的比较。在遗传物质长期的演化过程中,原本相同的DNA序列由于其中一条序列缺失了几个片断,或增加了几个片断,或某段子序列发生了位置的变化等,从而导致他们发生了不同,这两条序列不一定能进行精确的...

2011-04-09 23:20:35 1360

原创 生物信息学数据库

[b]综合数据库[/b]★ INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence Databank)。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。★ EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库。 http://www.ebi.ac.uk/embl.html ★ GenBank ,美国国家生物...

2011-04-09 23:16:18 2188

原创 常用单词

CNS 中枢神经系统AJC 解剖学Ka是酸性物质电离平衡常数(碱性是Kb)对于一种酸HnM Ka=([H]n[M])/[HM]HnM中的n是下标,[H] (n)[M]中的n是上标(也就是n次幂)pKa=-lgKaKb=Kw/KapKb=14-pKapKa——是弱酸性或弱碱性物质在50%解离时溶液的pH值。...

2010-06-21 07:58:11 105

原创 Analysis of Polar Compounds in Biological Matrix

Analysis of Polar Compounds in Biological Matrix with LC/MS/MS via “Normal Phase” LLE for Sample PreparationauthorsKristopher W. King, Chris Tran, Guangyu Zhao, Ling MorganTandem Labs, New Eng...

2010-06-19 21:50:55 102

原创 生物信息学网站

[b]通用的生物信息学门户[/b]www.ncbi.nlm.nih.gov美国国家生物技术信息中心主页。是关于公开数据库、生物信息学工具盒应用的资源,链接了许多有关生物信息学软件的有用站点和资源www.ebi.ac.ukEMBL欧洲生物信息学研究分支,生物学数据库和软件资源,其中大部分有精彩的教程支持www.expasy.chExPAS(expert pro...

2010-06-07 06:51:52 573

原创 CRO:让药品研发的世界变小

转:http://www.druggcp.net/htmls/17.html CRO即合同研究组织,是一种学术性或商业性的科学机构。研发者可委托其完成临床试验中的某些工作。一个全面的CRO可提供的服务包括临床前试验(如动物实验、体外组织实验)、临床试验及新药上市前后的其他试验。   企业逐渐接受CRO  药品的研发投入大、周期长、风险大,这些困难对任何一个药品研发...

2010-06-04 12:37:21 238

原创 关于CRO及CRO企业介绍

CRO(Contract Research Organization):合同研发组织,一般称之为"生物医药研发外包"。出现于上世纪80年代,一种学术性或商业性的科学机构。申办者可委托其[color=red]执行临床试验中的某些工作和任务[/color],此种委托必须作出书面规定,其目的是通过合同形式向[color=red]制药企业[/color]提供新药临床研究服务的专业公司。一个全面...

2010-06-04 12:23:13 871

空空如也

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