生物信息学所用的方法和技术

最新推荐文章于 2024-01-05 20:30:00 发布
最新推荐文章于 2024-01-05 20:30:00 发布
阅读量1.8k 收藏 7
点赞数 1
分类专栏： 生物信息化 文章标签： 生物 网络应用 数据结构 应用服务器 领域模型
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/iteye_8260/article/details/82043095
版权
本文介绍了生物信息学中常用的方法和技术，包括数学统计方法、动态规划、模式识别、数据库技术、人工神经网络、分子模型化、量子力学计算、分子动力学模拟、专家系统和Internet技术的应用。这些技术在DNA分析、基因识别、数据库管理和结构预测等方面发挥关键作用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、数学统计方法
数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如，在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔可夫模型进行基因识别。

二、动态规划方法
动态规划（Dynamic Programming）是一种通用的优化方法，其基本思想是：在状态空间中，根据目标函数，通过递推，求出一条从状态起点到状态终点的最优路径（代价最小的路径）。动态规划在

最低0.47元/天 解锁文章
iteye_8260
关注
专栏目录
2020.10.28【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第一章 引言）
10-28 1733
学习目标 定义生物信息学 解释生物信息学的范畴 解释为何球蛋白可以作为一个有用的例子阐释这一学科 描述何为基于网页和基于命令行的生物信息学手段 生物信息学定义 作者定义：使用计算机数据库和计算机算法来分析蛋白质、基因和组成生物体的所有DNA的完整集合（基因组）的学科。 美国国立卫生研究院（NIH）定义：研究、开发或应用计算工具和方法来拓宽对生物、医学、行为学或健康数据的使用，包括用于获取、储存、组织、分析和可视化这些数据的计算工具和方法 美国国家人类基因组研究所（NHGRI）定义：生物信
生物信息学题目整理： 陈润生
weixin_30762087的博客
06-28 2572
生物信息学题目整理： 陈润生： 一、什么是生物信息学？你怎么理解它的含义？ Genome informatics is a scientific discipline that encompasses all aspects of genome information acquisition, processing, storage, distribution, analysis, and ...
青岛西海岸惠普大数据_青岛大学教授李劲华：大数据与生物信息学问题与关键技术...
weixin_31998371的博客
12-20 680
编者按：本文作者在高校大数据教育教学领域拥有相对成熟的教学经验、独到的教育观点及创新的教学方法。作为全国高校人工智能与大数据创新联盟常务理事，积极推进大数据教育教学工作，本文内容根据作者在"赋能大数据教育专题"分享的内容整理而成，旨在为2020年高校数据科学与大数据技术专业、大数据管理与应用专业、大数据技术与应用专业赋能。青岛大学教授 李劲华一、相关背景(一)生物信息学产生背景众所周知，生物信息学...
生物信息学笔记02 -- 研究的一般方法
JamSlade的博客
10-26 918
以信息为源头，识别基因组序列中代表基因的编码区，阐明的信息特征，破译隐藏在DNA序列中的。
生物信息的关键技术
ATAOL的博客
03-20 375
人工智能技术在生物信息学中的应用：如深度学习、机器学习、数据挖掘等技术，可用于生物信息数据的分类、预测、分析和建模等方面。后基因组学：指对基因组测序后的生物学研究，包括元基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学等研究领域。生物信息学算法：包括序列比对、基因预测、蛋白质结构预测等一系列计算方法，用于解析和分析生物信息数据。生物信息学数据库：收集整理生物实验数据和文献信息，为生物信息学的研究和应用提供数据和工具支持。系统生物学：综合运用生物学、数学、物理学等多学科知识，研究生物系统整体性质和复杂性质。
一些生物信息学常用的分析法的介绍
wangprince2017
08-19 1万+
我个人认为生物信息学是生命科学和计算机科学还有统计学所构成的一门交叉学科。私以为目前网络上的文献有些晦涩难懂。为了更好地帮助新手入门，现将目前网络上的各种文献资料总结为本文，供各位同行参阅。 目前生物信息学常用的分析法有如下几种： 基因差异表达的显著性分析(又称差异表达分析) DEG 功能富集分析(Go分析和Kegg分析) 加权基因共表达网络分析(WeightedGeneCo-exp...
进行生物信息学分析所应该具备的技能
opengel的博客
03-18 1279
计算机技能工具 linux,perl,python,R,matlab。 补充：C，Java 算法经典的机器学习算法:： 数据处理的技能 从指定的网站上爬取相关的内容， 最新进展的算法:
生物信息学中的决策树应用：基因表达数据分析的高级案例
近年来，决策树作为一种广泛使用的机器学习技术，在生物信息学中展示了其强大的应用潜力。它能够处理基因表达数据、疾病诊断、蛋白质功能分类等多种类型的问题。决策树以其可解释性强、处理速度快和高效性等优点，...
学计算机还是学生物,生物医学工程，到底是学生物，还是学医？
weixin_39861882的博客
06-22 1425
我们在之前的推文中，将生物工程和生物医学工程捏在一起说过一次，但今天，讯哥想单独说说【生物医学工程】。生物医学工程，英文是Biomedical Engineering，简称BME，乍一看，可能不少童鞋会疑惑：这是学生物，还是学医嘞？事实上，BME并非传统意义上的生物类学科，它现在已然成为了生物类申请的一个热门。下面就随讯哥一起来了解一下吧。专业简介生物医学工程(Biomedical Enginee...
生物信息学【3】：相关理论方法
ZhuNian的学习乐园
12-22 3166
由于最近在做BRCA-lncRNA相关的生信课题研究，在看到相关论文中的一些模型和方法，整理一下，供自己和大家一起学习。 1.生存分析: log-rank检验在什么情况下失效? 2.DESeq2详细用法 3.TCGA+biomarker———风险因子关联图 4.ROC曲线，混淆矩阵，开集闭集等概念
基于人工神经网络数据挖掘的生物信息分析软件 源代码 Java
11-04
在这里，以Java为程序设计语言，运用强大的JDK工具包，在Eclipse3.2的平台上，以基因数据为研究对象，设计出一款基于人工神经网络数据挖掘的生物信息分析软件。根据基因数据结构，对基因序列的碱基进行编码变换；用户则根据自己的需求通过人机交互界面来自定义网络某些参数，将样本基因数据传入到神经网络当中，继而进行有限次迭代处理，不断调整分布处理单元的连接强度。最后将目标基因数据输入到已经锻炼好的网络中，来对目标基因的未知序列进行预测。运行结果：软件能够无误的运行，且能够较好的对基因序列进行预测。
【计算机科学】【2005.12】神经网络在生物数据中的应用
weixin_42825609的博客
12-06 245
本文为英国伦敦大学（作者：Aristoklis.D. Anastasiadis）的博士论文，共184页。 在分类问题中训练神经网络，特别是当涉及生物数据时，是一项非常具有挑战性的任务。到目前为止，已经提出了许多训练算法来改善神经网络的性能。一种流行的方法是使用批量学习，对每个权值使用不同的自适应学习率。大多数现有的该类算法都是基于启发式的，并且它们不能保证从任何初始权值集收敛到局部最小值。此外，...
基于人工神经网络的生物信息软件_“深度学习”，“人工神经网络”，你知道二者之间的关系吗？...
weixin_39862847的博客
11-22 268
更多原创科普作品，请关注我哦，科普苑！自从2016年Alphago 大败围棋世界冠军李世石以来，“AI(人工智能)”、“深度学习”、“人工神经网络”等词大热。“深度学习”出现的地方似乎总少不了“人工神经网络”，反之亦然。这是为啥子嘞？朋友们有没有想过背后的原因？深度学习是一类机器学习算法，使用多个层逐步从原始输入中提取更高级别的特征。例如在图像处理中，较低层可以识别边缘，而较高层可以识别出更复杂的...
通过4个步骤，入门生物信息学分析
最新发布
SAM_biotech的博客
01-05 5768
二十一世纪是生物的世纪，该观点已提出多年。 甚至有人提出，这句话的真正含义应该是“二十一世纪在各行各业都能找到曾经学生物的人”。 对此，我们不再做进一步推敲。 但可以看出的是，越来越多人已经投身于生物相关研究了。 还不问问自己，是不是快成了那个掉队宝宝啦？
生物信息学分析常用网站
热门推荐
Phd丨jay的博客
06-09 2万+
1.  BLAST（核酸蛋白序列比对）：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi2.  miRBase（miRNA数据库网站）：http://www.mirbase.org/3.  PlantCARE（启动子元件分析网站）：    http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/4.  W...
生物信息学简介 -整理综合
jianghui的专栏
04-14 4202
生物信息学是一门利用计算机技术研究生物系统之规律的学科。它建立在分子生物学的基础之上，并以计算机为工具对生物信息进行存储、检索和分析。其研究重点体现在基因组学和蛋白质组学两个方面，具体来说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。生物信息学是当今自然科学与生命科学的重大前沿科学之一。 一、 发展历程 1866年孟德尔从实验上提出了基因是以生物成分存在的假设，5年以后Mie
《生物信息专业都学些什么编程语言？》读后感
Attano的博客
10-06 5775
哀家毕业论文就是做的生物信息方向，《150株酸菜乳酸菌的菌种类型分析》，NCBI，真是怀念啊~~ INSD,国际核酸序列数据库 EMBL库，欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库 GenBank ，美国国家生物技术信息中心 （NCBI）所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库 DNA Databank of Japan (
生物学和计算机科学结合的学科,美国生物信息学和计算生物学解析
weixin_36230541的博客
07-09 2663
一、生物信息学 生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重...
生信学习笔记：生物信息学测序分析基本流程入门笔记
twocanis的博客
11-25 1万+
文章目录前言短序列比对软件sam文件insertsize基因差异表达计算变异检测物种组成与丰富度计算kmer估计基因组大小序列拼接Pregraph常用序列拼接软件基因组污染分析RNA-seq与meta序列拼接基因功能注释非编码RNA小RNA共线性分析在线序列分析序列比对数据下载 前言 根据B站教程生物信息快速入门边自学边随手记的笔记，省略了开头几节测序原理以及数据质控，在之前的文章中有粗略提过该部分。 目前我自己理解的大致流程基本就是 测序——质控——比对拼接（contig、scaffol、mappingd
形态学图像处理：基于数学形态学的图像分析和识别。
而形态学本身一般指生物学中研究动物和植物结构的一个分支，而在数字图像处理中，它被转化为数学形态学，用于对图像进行分析和识别的工具。形态学图像处理的基本思想是使用具有一定形态的结构元素去度量和提取图像中...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值