Bioinformatics
HerinaYang
这个作者很懒,什么都没留下…
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Bioinformatics 成长路线
人类基因组计划是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索工程。其宗旨在于测定组成人类染色体中所包含的30亿个碱基对所组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。1985年,人类基因组计划由美国科学家率先提出,预算达30亿美金。主要由美国、法国、中国、日本、德国等国家通力合作研究,于2001年发表人类基因组工作草图,是人类基因组计划成功的里程...原创 2018-12-22 16:24:43 · 267 阅读 · 0 评论 -
人类基因组计划成果
1.人类的蛋白编码基因只有2万~2.5万!基因是编码蛋白质的一段DNA序列,是遗传的基本功能单位。2万多个基因决定了一个人的外貌身高等,我想这应该是世界上总是会有人长得和你相似的原因吧!人类基因总数约为果蝇或者线虫的两倍,基因复杂度高得多。2.人类基因重复率达5.3%!人类基因的重复率显著大于鼠等生物,在进化历程中,人类的遗传物质经过了结构和功能上的变革,有别于其他灵长类动物。3....原创 2018-12-22 19:32:53 · 3339 阅读 · 0 评论 -
NCBI Genbank核苷酸序列数据库检索基因序列解读
核酸数据库Genbank数据库=Nucleotide数据库(一)基因序列注释内容解析以dut基因编码的大肠杆菌酶dutpase为例;在Nucleotide数据库search X01714或者dutpase,检索链接https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/x01714;得到以下信息。1.LocusLocus:编号 长度 分子类别 基因拓扑类型...原创 2019-03-09 11:20:43 · 20157 阅读 · 0 评论 -
数据分析图表解读——生信part
https://jingyan.baidu.com/article/0964eca212f6a88284f53675.html16SRNAV3-V4测序效果最佳1.柱状图横坐标:各样本,一个条形图代表一个样本;纵坐标:各分类层级(界门纲目科属种)的序列数目或者百分比,不同颜色表示不同层级,序列只计入分类得出的最低层级。2韦恩图一般只能表示五个样本或者分组3.稀释曲线...转载 2019-03-14 16:34:08 · 16097 阅读 · 0 评论 -
菌群多样性分析报告
参考链接https://www.docin.com/p-2107733531.html在开始实验项目之前,明确实验流程,一步一步获取实验结果,以可视化工具展现结果,并加以生物学意义上的分析,获取完整的分析报告。下面给出菌群多样性分析报告中应包含的大致内容,并对实验流程做出指导性的阐述。1.项目背景与概况简单阐述所研究项目的国内外现状,本项目的目的与意义。2.材料与方法(materi...原创 2019-03-16 23:01:32 · 10337 阅读 · 0 评论 -
微生物组16S rRNA数据分析
原文链接:https://www.jianshu.com/p/920a5ce3a7a0微生物组16sRNA 数据分析常规流程:划分OTU , 构造距离矩阵,分析物种多样性指数,构建序列的进化树及物种注释信息。可以使用USEARCH、VSearch、Qiime来进行分析。1、划分OTUOTU为操作分类单元,基于序列相似度高于97%,将每个sample划分成不同OTU,每个OTU用一条...转载 2019-03-13 16:52:53 · 13025 阅读 · 2 评论