菌群多样性分析报告

参考链接https://www.docin.com/p-2107733531.html

在开始实验项目之前，明确实验流程，一步一步获取实验结果，以可视化工具展现结果，并加以生物学意义上的分析，获取完整的分析报告。下面给出菌群多样性分析报告中应包含的大致内容，并对实验流程做出指导性的阐述。

1.项目背景与概况

简单阐述所研究项目的国内外现状，本项目的目的与意义。

2.材料与方法（material and methods）

获取材料的方式主要有：现有数据库下载生物序列；测序实验采集；方法，这一部分内容主要阐述实验流程，各个步骤所采用的技术、算法、工具。

2.1原始数据测定实验流程

2.2数据分析流程

利用原始测序数据以及样本的分组信息进行一系列数据分析，流程如下。

（1）序列预处理和质量控制

（2）OTU划分与分类

划分得到样本的OTUs.获取各OTU的代表序列，通过各OTU所包含的reads数目，创建OTU_table;用于分类level鉴定和系统发育学分析。该分析过程可用一些可视化工具