Python 导入通讯录:将.csv文件转换为.vcf文件

Python 将.csv文件转换为.vcf文件

你好啊,在代码世界遨游的朋友们。应家里工作需要导入大量联系方式,就要我一个学习软件工程的弱鸡来帮忙,于是在弱鸡4小时的拼命查代码中,终于搞定了人生中第一个真实使用到的程序代码。所以我迫不及待的来我的知识源泉中写下了这个文章,因为我觉得这里写的文章太过于。。分散吧(不知道用啥词),我查了不知道多少个文章然后结合结合才搞定这一个只有几十行代码的东西,所以我想自己也写一个,一会别的萌新看到了也会一目了然,嘻嘻…

清洗数据

Excel数据
当我拿到我家里给我的数据时是一个Excel表格,里面有各种各样的数据,数据之中还有超链接,非常的“脏”,所以我们要进行清洗一下。因为我们导入手机通讯录的话,需要的只是文本文件,于是我将需要的数据复制到一个新的文本文档中,这样可以直接消除Excel中附加的超链接。(这里应该可以用代码解决的,但是我不会。。。原谅我还是个小菜鸡)
txt

这时我们将原来的Excel清空,放入文本文档中的数据(复制粘贴即可),然后点击另存为.csv文件。接下来就可以交给我们的大python了:

import os
f
  • 0
    点赞
  • 4
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
.vcf.gz 文件是一种常见的基因组数据格式,用于存储变异信息,经过压缩以节省存储空间。它遵循Variant Call Format(VCF)标准。而MR分析通常指的是关联研究中的Meta 分析,用于合并多个研究的数据结果,以得到更为广泛且可能更具有统计学意义的结论。将.vcf.gz文件转换为MR分析文件需要经过几个步骤,具体过程如下: 1. 解压缩.vcf.gz文件:使用如`bcftools`的工具,可以将.vcf.gz文件解压缩得到未压缩的.vcf文件。 ```bash bcftools view -Ou input.vcf.gz | bgzip -c > output.vcf.gz tabix -p vcf output.vcf.gz ``` 2. 数据预处理:可能需要进行过滤、转换等预处理步骤,以确保数据质量并符合MR分析的需要。这可能包括去除不完整的记录、转换坐标系统、处理缺失数据等。 3. 提取MR分析所需数据:MR分析通常需要特定的统计量,如效应大小(effect size)、标准误(standard error)等。这通常需要从.vcf文件中提取基因型数据,并计算出所需的统计量。在某些情况下,可能需要使用特定的工具或编写脚本来计算这些统计量。 4. 准备MR分析文件:根据你的MR分析软件要求,将提取的数据整理成特定格式文件。大多数MR分析软件都有一套自己的输入文件格式要求,需要根据这些要求来整理和格式化数据。 请注意,上述步骤是一个大致的流程,具体操作可能会根据你所使用的工具、数据的特征以及MR分析的要求有所不同。在实际操作中,你可能需要查阅相关的生物信息学工具文档和统计分析指南来详细地执行转换过程。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值