# sitk::ERROR: No ImageJ/Fiji application found.问题解决过程-

环境：CentOS，使用conda管理虚拟环境

• 没有安装ImageJ

  • Fiji (imagej.net)

  • 安装numpy

• 可能是由于没有配置环境变量导致

  • 修改conda环境变量

    • conda env config vars set SITK_SHOW_COMMAND=/location/Fiji.app/ImageJ-linux64 -n env_name

    • conda env config vars set PATH=$PATH:$SITK_SHOW_COMMAND -n env_name

  • 如果在修改base环境变量

    • 修改~/.bash_profile

    • 添加 export PATH=$PATH:$SITK_SHOW_COMMAND

    • source ~/.bash_profile更新环境变量

  • 直接把Fiji.app丢到python解释器目录下

• 可能是ImageJ缺少JAVA运行时环境导致

  • java --version查看是否安装java

    • apt-get install java（Ubantu）

    • yum install java-1.8.0-openjdk

  • 直接安装ImageJ与jre捆绑版本

    • 下载 (imagej.net)

• 最后发现是因为simpleitk版本过高

  • 使用conda install -c simpleitk simpleitk=1.2降低版本

    • 出现了ResolvePackageNotFound：Python 3.1

      • 意思是当前python版本过低

        • 这是由于conda 4.10的bug导致，当前python版本为3.10+时，conda会误以为是3.1

          • 解决方法：

            • 升级conda：conda update conda

            • 降低python版本：conda install python=3.7（simpleitk1.2.4与Python3.8以下兼容）

参考资料：

r - Conda reports PackagesNotFoundError: python=3.1 for reticulate environment - Stack Overflow

python - SimpleITK.Show() generates error in ImageJ on Linux - Stack Overflow

python - Can not "link"SimpleITK::Show() with FIJI - Stack Overflow

python - SimpleITK cannot show image - Stack Overflow

ubuntu 安装 imagej_为什么imagej安装后无法使用-CSDN博客

sitk::ERROR: No ImageJ/Fiji application found.-CSDN博客

Problem linking SimpleITK with ImageJ - Beginner Questions - ITK