AGNES(Agglomerative Nesting)算法是一种基于组平均的层次聚类算法,用于将数据集中的样本逐步合并成不同的聚类簇。本文将介绍如何使用AGNES算法对多维数组进行聚类,并使用欧式距离来度量样本之间的相似性。
首先,我们需要定义欧式距离的计算方法。欧式距离是一种常用的距离度量方式,用于衡量向量空间中两个点之间的距离。对于两个多维数组样本x和y,欧式距离的计算公式如下:
def euclidean_distance(x, y):
return sqrt(sum(pow(a - b, 2) for a, b in zip(x, y)))
上述代码中,我们使用了zip函数将x和y中对应位置的元素进行配对,并计算其差值的平方。然后,使用sum函数对所有差值的平方进行求和,并使用sqrt函数计算平方和的平方根,从而得到欧式距离。
接下来,我们将使用AGNES算法对多维数组进行聚类。AGNES算法的核心思想是通过计算样本之间的相似性度量值来不断合并最相似的样本,直到满足停止条件为止。
def agnes_clustering(data, k):
clusters = [[x] for x in data] # 初始化每个样本为一个簇
while len(clusters) > k:
min_distance = float('inf')