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RSS订阅原创 病毒组学数据分析 -03 DRAM-V 病毒序列识别（剔除假阳性）
DRAM（Distilling and Refining Annotations of Metabolism，提取和精练代谢注释）是一种用于注释宏基因组组装基因组和VirSorter确定的病毒重叠群的工具。DRAM 使用KEGG、UniRef90、PFAM、dbCAN、RefSeq 病毒、VOGDB和MEROPS注释 MAG（metagenome assembled genomes，宏基因组组装基因组 ） ，也可使用病毒重叠群肽酶数据库以及自定义用户数据库。
2023-01-11 15:37:17
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原创 获取物种分类信息的方法（TaxonKit/ete3/Biopython）
解决数据分析中获取物种分类地位困难的问题。提供通过ncbi号、物种名、taoxid号进行物种分类信息获取的方法。
2022-12-29 09:59:43
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原创 病毒组学数据分析 -03 CheckV病毒序列识别
CheckV 是一个完全自动化的命令行管道，用于评估单重叠群病毒基因组的质量，包括识别集成原病毒的宿主污染、估计基因组片段的完整性以及识别封闭基因组。
2022-02-21 22:19:48
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原创 病毒组学数据分析 -03 deepvirfinder病毒序列识别
介绍一种无参考和无比对的机器学习方法 DeepVirFinder，用于使用深度学习识别宏基因组数据中的病毒序列。
2022-01-13 23:04:46
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原创 病毒组学数据分析 -01 kneaddata数据质控
kneaddata软件介绍，使用bowtie2去除人体DNA污染，并通过trimmomatic对序列进行筛选，最后fastqc报告序列质控结果
2022-01-12 23:11:03
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空空如也
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