DTI脑影像处理流程-配准机器生成的特征图

仅简单记录自己科研过程中的一些内容

在学习影像处理时影像数据里有机器生成的FA,ADC等特征图，为了尝试使用这些特征图进行科研任务，再不用其他软件进行处理时实现特征图的配准，将特征图配准到标准的脑空间，具体步骤如下：

1. 通过B0像，结合python处理DTI影响的包Dipy，首先实现B0像脑组织的分割，得到脑组织模板。Dipy的具体使用及说明见链接：

DIPY - Tutorials

2. 将该模板与FA,ADC等特征图相乘，取出对应脑组织部分的特征。因为FA,ADC已经经过一系列处理，缺少解剖信息。

3.结合薄层T1结构像进行配准，首先使用MATLAB软件包SPM里面的cat12，实现T1结构像脑组织的分割，会生成三个分割文件，使用wms.xxx的文件去进行配准。关于cat12实现结构像的分割见链接：(13条消息) 基于cat12和SPM12进行VBM&SBM数据分析笔记1——数据预处理_@Beta的博客-CSDN博客_cat12软件

配准过程有关键的两步：

1）将T1结构像与B0像配准，使用SPM里面的normalize来进行配准，具体流程见链接：

Siemens Trio 3.0T，DTT与TI像融合，及FA图与自身模板配准的问题，跪谢！ | Forum of resting-state fMRI

2）将和B0像配准后的T1配准到标准脑模板，例如MNI152，再将配准过程写入DTI特征参数图，则实现了对影像设备自带参数图到标准脑空间的配准。