tRNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs,tsRNAs)是一类新型的小RNA,广泛存在于原核生物和真核生物中。据报道,tsRNAs可表现出时空表达模式,在许多生物过程中都可以作为调节分子发挥作用。然而目前还没有一个非常全面,可覆盖多物种的数据库来满足研究人员的需求,为解决这个问题,四川大学华西医院在《Nucleic Acids Research》上发表了tsRBase数据库。
这个数据库覆盖20个物种的14000多个公开可用的小RNA序列数据,鉴定出了121942个tsRNAs。数据库的开发者们收集了不同组织/细胞系的样本,或者在不同处理和遗传背景下的样本,从而有助于科学家们研究不同条件下tsRNAs的特定表达模式。用户们可通过登陆(地址见文末)访问数据库。
为了让大家对tsRBase有一个整体的了解,下面我来给大家介绍一下数据库的“Search”、“Browse”、“tsRNA Targets”和“tsRNA Literatures”这四部分。