蛋白相互作用数据库，STRING使用指南

对于基因组数据分析而言的话，我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。

 

蛋白相互作用分析的数据库有很多，至于为什么选择STRING，还是在于其强大的可视化，以及自定义功能。这样我们可以得到数据结果的同时，还可以得到相对好看的图。下面我们就来介绍一下STRING 数据库如何使用吧~

 

 

基本检索

 

 

我们在打开数据库之后，在菜单栏可以看到很多种来进行相互作用关系预测的选项。如果我们有一个目标蛋白，想要查看这个蛋白的可能的相互作用蛋白可以选择Protein by name；如果我们有很多蛋白，想要查看这些蛋白之间的相互作用关系，那就可以选择Multiple proteins。

 

 

 

 

由于我们在之前的差异表达分析的时候，可以得到很多基因，所以我们这里选择Multiple proteins来进行下一步分析。这里我们需要的输入的就是基因名即可，基因名与基因名之间通过通过换行来间隔。另外需要做的就是选择目标物种，由于我们做的是人的分析，所以选择人即可。

 

 

文章剩余内容《《《《