Spark分布式内存及存储管理机制浅析

最新推荐文章于 2024-03-20 13:30:54 发布

九剑问天

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Apache Spark 是专为大规模数据处理而设计的快速通用的计算引擎同，它最初是UC Berkeley AMP lab (加州大学伯克利分校的AMP实验室)所开源的类Hadoop MapReduce的通用并行框架。

Spark拥有Hadoop MapReduce所具有的优点，但不同于MapReduce的是其中间输出结果更倾向于保存在内存中，从而不再需要读写HDFS，因此Spark的计算效率得到了极大的提升，与此同时，Spark内置了丰富的函数、算法，能更好地适用于数据挖掘与机器学习等应用，这使其在大数据领域占据了更加重要的地位。

在实践过程中只有了解Spark对存储特别是内存的管理机制，才正使其发挥更佳的性能。

在Spark中专门有一整套成熟的内存管理模块，且扮演着非常重要的角色，本文将从堆内外内存、统一内存管理机制（Unified Memory Manager）及BlockManager等方面，尝试阐述Spark分布式内存及存储管理机制。

堆内外内存

Spark是由Scala编写，而Scala是执行于JVM上的类JAVA语言。Spark在执行的过程中，同样脱离不了JVM的支撑，Spark Executor本身的内存管理就是基于JVM传统内存管理的，但是Spark可以在Executor所属节点的系统内存之中另行开辟空间作为Off-heap使用，这极大的方便了Spark的数据操作，但这并不意味着Spark放弃了对On-heap内存的优化，相反的是。随着Spark不断升级，其对On-heap内存的管理愈发详尽，细化到Task层级，在Executor中的每一个Task都可以完成对On-heap以及Off-heap内存堆的使用。

1. 堆内内存（On-heap）

Executor中的众多Task共享使用同一块On-heap内存，而这一块On-heap内存被分为三部分：

Execution内存：此内存主要用于任务shuffer、join、sort等。
Storage内存：此内存主要用于缓存本节点或者其它节点间的数据传输，具体包括RDD的缓存数据、广播变量、自定义累加器等
其它内存。此内存用于存储除了上述两种用途之外的其它内存（对象），比如内部实例等

受限于JVM本身，Spark对堆内内存的管理只是一种记录式管理，每当有内存（实例）在申请后或释放前，Spark会对此进行记录。

在申请内存时，首先由Spark在Task中新建一个实例，然后JVM收到请求后在on-heap中为此实例分配空间，并且为Spark创建该实例的引用，Spark拿到该引用信息之后，将引用及其占用的内存信息进行保存。释放内存则先行记录释放实例，删除上述拿到的引用，最后交由JVM本身机制释放回收on-heap内存。

可以发现，在on-heap内存申请与释放过程中存在着误差。

Spark中的对象大都为字节流形式的可序列化对象（serialization），这些对象占用内存的情况与JVM相似，可以直接通过计算获得，但是非序列化对象只能估算内存占用值，这就导致Spark并不能完全掌握on-heap的内存占用情况。

而在内存释放的过程中，内存误差的风险更大，因为虽然有些对象在Spark内被标记删除，如果JVM尚未真正回收，这些对象占用的空间并没有被释放，这就导致Spark内存记录失真。

Spark对on-heap内存管理的不准确性，也就使其从根本上是无法避免OOM的。

虽然无法避免，但是Spark从多处下手，尽量优化了Executor运行中的内存使用情况。

Spark程序运行时，spark.executor.memory参数决定了Spark JVM heap的大小，但在实际中，Spark并不会将此数值完全用尽，spark.storage.safetyFraction将安全空间阈值设置为了0.9，这就使Spark保留了部分空间作为预留内存使用，以期减少OOM出现。

1. 堆外内存：

为突破JVM的内存枷锁，Spark另行开辟了堆外内存使用，堆外内存可由Executor单独创建，用于存储已被序列化的二进制，堆外内存相比堆内内存有诸多好处：

在大内存情境下表现更佳
有利于改善垃圾回收造成的性能干扰
JVM进程数据共享

不过相对堆内内存，Off-heap只能用于存储序列化文件，这也造成了反序列化过程中的性能损耗，但这种损耗与Off-heap带来的Shuffle效率提升相比是完全值得的。

Spark Shuffle的底层传输实现是基于Netty，Netty的在进行网络传输的过程中同样使用off-heap，off-heap不足会导致任务缓慢或者失败，当Spark出现executor loast/ shuffle file cannot find/task lost等情况时，就需要调大Executor的堆外内存了。

堆外内存被Spark分为了两部分：Storage与Execution，其区别已在上文描述，此处不再赘述。

统一内存管理机制（Unified Memory Manager）

在Spark中内存管理的工作主要由MemoryManager组件来完成，而MemoryManager又有两种不同的实现，一种为StaticMemoryManager，另一种为UnifiedMemoryManager，在新版中后者（UnifiedMemoryManager）替代前者成为默认机制，本文也主要关注UnifiedMemoryManager。

UnifiedMemoryManager将Spark堆内内存分为三部分：预留内存区（Reserved Memory）、自由内存区（Usable Memory）、统一管理内存区（Unified Memory）。

此处所述部分，与上述Spark堆内内存的划分似乎有冲突，但实际上并非如此，详情见如下内容。

预留内存区（Reserved Memory）默认为300M，Spark据此值的1.5倍计算出最小所需内存值（MinSystemMemory），如果系统可用内存小于此值的话，Spark会抛出OOM异常。

自由内存区（Usable Memory）为系统最大内存减去预留内存区的值

统一管理内存区（Unified Memory）为自由内存区的60%，这些内存将由Storage与Execution共享，两者各占用一半，但当已方内存不足时，可占用对方空间。

内存划分见下图：

需要注意的是Reserved Memory只是逻辑上的概念，其与Other一起存储其它类型的数据。

可以发现，UnifiedMemoryManager的三部分内存区域划分，在实际上依旧是Storage、Execution、Other。这也就与上述堆内内存的介绍内容相统一了。

下面，将就Storage与Execution的内存写入机制进行简要的分析。

首先是Storage，在Storage中一般存储的是Task运行完成之后的输出结果（中间结果），在Task运行的生命周期中，如果Task运行结果需要持久化（或需要缓存），则调用Spark Block Manager模块，由此模块调用putBytes()方法完成实际写入动作，但是在写入之前，Block Manager会调用acquireStorageMemory()判断内存时否足够，判断逻辑如下：

如果acquireStorageMemory()发现申请内存大于Unified Memory内可用内存总量，则报出内存不足
如果申请内存小于Unified Memory内可用内存总量，但大于Storage预分配可用量，则从Execution预分配内存区借用内存，相应的Execution可用内存减去被借走的内存量，从而完成整个动态内存调整

在申请到内存空间之后，putBytes()将以字符流的形式将数据写入。

其次是Execution，前文提到Execution主要是存储Shuffle的数据，在Shuffle的过程中会调用 ShuffleExternalSorter组件，它负责将Record数据（Shuffle数据的逻辑存储概念）写入数据页中，对数据页将在BlockManager中进行简要说明。

对Execution数据，分别区分On-heap与Off-heap两种分配方式，Off-heap相对简单，主要是通过每个Task任务管理相应的内存空间，在On-heap内存申请过程中，当Execution内存不够使用时，Spark一定会把StorageMemoryPool的可用内存全部借给Execution使用，如果当前StorageMemoryPool比初始时要大，说明Storage借用了Execution的内存空间，StorageMemoryPool会调用shrinkPoolToFreeSpace回收内存并减持，这部分释放出的内存空间便再次给予了Execution。

可以看出，在统一内存管理机制中，Execution的优先级比Storage更高，动态调整过程中，如果Execution内存空间被对方占用时，Execution可以将Storage占用的部分转存到硬盘，而后将Storage占用的内存收回，但反之却不行。产生这种情况的主要原因，是Execution存储是的Shuffle过程的数据，这部分数据涉及较为复杂，不能进行简单的“回收”工作。

BlockManager存储模块

BlockManager是内嵌于Spark的一套分布式存储管理系统，它管理着Spark内所有数据操作，提供了数据的本地远程Writer/Read封装，而Unified Memory Manager组件的运行更离不开BlockManager的支持，因为Spark的分布式特性，BlockManager也是分布式的，它随Spark一起运行在集群所有的节点上，包括Driver以及Executor，相似的地，BlockManager同样是Master-Slaves结构，在SparkEnv启动的时候，会根据启动在Driver还是Executor分别启动Master与Slave，在Driver上运行的是BlockManagerMaster，而Executor上则为BlockManagerSlave。

详细来讲，在Driver启动时，会构造BlockManagerMasterEndpoint，并注册自己，而Executor则通过initialize实例化本机上的BlockManager并创建BlockManagerSlaveEndpoint轮训接收BlockManagerMasterEndpoint的消息命令，最后Executor上的BlockManager会向BlockManagerMasterEndpoint注册自己信息。

在整个流程中，Executor上的BlockManager向Driver上的Master注册自己的信息，其它BlockManager则按需从Master内拉取数据进行cache 、shuffle等动作。

在BlockManger内部，有多种方式实现对数据的存储（持久），主要有On-heap，Off-heap，Disk等，本文主要分析内存中的Storage与Execution管理。

1. BlockManager中的Storage管理

在Spark中，Transformation与Action是两种基本数据操作，这两种数据处理方式的作用对象则叫RDD（弹性分布式数据集），在多次Transformation之后，各RDD之间也就形成了基本的血缘信息，但此时多种RDD的转换在任务引擎中心中并不会真正引起数据变动（也可以称之为数据运算），除非当应用执行到了Action操作。

Action操作是触发数据的运算的入口，Action操作初始化时，Task会从持久层校验RDD是否已被缓存，其中RDD的缓存主要便是内存中的Storage类型，这些数据可以存储在On-heap与Off-heap内。

Task是如何判断RDD是否已被缓存呢？

在存储层，BlockManager的存储单位是Block，而RDD则由逻辑概念上的Partition组成，每一个Partition在处理完成后都对应一个Block，这种关系是稳定维一的，这种关系的存在使Task与BlockManager可以完成数据逻辑层上的通信。

严格来讲在RDD计算时，首先会根据RDD ID和Partition Index构造出Block ID，Task（Exectutor）即可以从BlockManager中按此ID查询对应的Block，如果此Block已被缓存入Storage内，Task会使用已缓存数据进行下一组的Transformation（Action），如果没有，Task会按照血缘信息（LIneage）重新计算所需RDD，而生成的RDD便根据它所有Partition的Block ID进行Storage内部存储。

基于此，BlockManger就完成了对RDD与Storage存储空间的统一管理，逻辑上的Partition数据也就转换为了的Block Memory空间。

1. BlockManager中的Execution管理

Execution主要是Spark Shuffle过程中的内存管理。

Shuffle过程可以说是分布式运算的灵魂所在，而Shuffle的不确定性也是影响整个应用的关键之处。

毫无疑问，Spark作为一个分布式系统，它将整个集群的存储进行了相对统一的管理，在Shuffle的过程中，RDD被打散重装，BlockManger则对数据进行了重新分区，这就必然造成了伴随Shuffle阶段的数据读与写——这种读/写的效率很大程序上取决于数据所处节点的相对空间位置，在Shuffle中，Spark倾向于使用AppendOnlyMap来存储中间数据，并将堆内堆外进行了抽象，也就是上文提到的数据页，数据页使Spark上层逻辑无需关心使用的是On-heap内的Execution还是Off-heap的Execution，相当于对不同位置的Execution进行了统一封装。

因为RDD与Block的统一性，逻辑上的RDD传输最终会相应的转换成Block操作，Exectutor上的各个Task会通过使用BlockManager组件接口，由BlockManagerMaster向BlockManagerMasterEndpoint查询其本身运算所需的BlockID信息以及集群中有哪些Executor已经保存了该Block数据。

也许读者此时比较疑惑，既然读取到了BlockID，那么根据ID读写数据即可，何必要了解集群中有哪些Executor已经保存了该Block数据。

其实，这主要体现了大数据领域核心思想之一的“移动计算，而不是移动数据”，当Spark发现已保存该Block数据的Executor上的计算逻辑与当前Executor（Task）一致时，会优先直接使用远程端Executor来完成相关运算，这比将数据传输至本地要高效的多。

结语

了解Spark的JVM内存管理机制以及BlockManager组件对提升应用程序的稳定与效率而言至关重要，特别是Shuffle过程中数据运算、传输的情况往往决定了应用程序的健壮性，而这一部分更需要对Stage\Cache\Partitio\GC的持久优化，本文并未对此深入展开，至此Spark的内存管理及BlockManager已简单分析完毕。