ITK读mhd文件报错RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage......

最新推荐文章于 2023-10-11 17:05:22 发布
最新推荐文章于 2023-10-11 17:05:22 发布
阅读量9.3k 收藏 2
点赞数 1
分类专栏： deepin系统应用 python标准库 文章标签： 深度学习 pytorch
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/liqiang12689/article/details/106431259
版权
  1. python下使用sitk读取mhd文件时提示：
    RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:491:
    itk::ERROR: MetaImageIO(0x55fcf29e8e30): File cannot be read: /home/liqiang/PycharmProjects/projects/COPDclassifica/Test.mhd for reading.
    Reason: No such file or directory
    在这里插入图片描述
  2. 解决方法：
    原因其实很简单，我为了方便将文件名由自动生成的修改成为test.mhd这是不允许的，将文件名修改回来后，正确读取，bingo。。

希望各位以后多注意此问题，切勿修改文件名，切勿修改文件名，切勿修改文件名！！！！！！！！！！！！

liqiang12689
关注
专栏目录
python read()读取图片_可以python sitk.ReadImage读取列表/系列图像吗？
weixin_42509708的博客
02-19 3567
我不明白sitk.ReadImage是否可以读取或不读取图像列表？我没有设法找到一个示例显示如何列出图像应该输入到函数。但是在功能文件中它说：ReadImage(**VectorString fileNames**, itk::simple::PixelIDValueEnum outputPixelType) -> ImageReadImage(std::string const &...
[SimpleITK + python]sitk.show()与imageJ结合使用常见的问题
z13131076636的博客
10-29 7738
在python中配置simpleITK时，遇到了以下这个问题。 simpleITK已经通过pip install安装，但是sitk.show()功能无法正常使用，类似如下 实例代码 import SimpleITK as sitk import sys import os example = sitk.ReadImage("filename") sitk.show(example) 在s...
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileWriter_Execute
最新发布
m0_72133175的博客
10-11 490
先检查路径里面有没有包含中文，有的话改为English.Damn(重音).
【Debug记录】Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute|路径不存在|../../..\ is not exist
m0_51141265的博客
03-12 5392
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK/Code/IO/src/sitkImageReaderBase.cxx:97:sitk::ERROR: The file "./dataset/data_fix\ct_0001.nii.gz" does not exist.
SimpleITK读取mhd文件报错Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK-build/
weixin_43539289的博客
03-18 4369
在python中用SimpleITK读取mhd文件报错 Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK-build/ No such file or directory. 原因是读取mhd文件时文件夹中必须同时要有对应的raw文件，我在处理文件的时候把raw文件删除了，所以出现报错。把raw文件恢复之后不再报错。 ...
已解决RuntimeError: Exception throm in SimplelTk
努力让自己发光，对的人才能迎着光而来
04-10 8336
已解决return _SimpleITK.ImageFileReader_Execute(self) RuntimeError: Exception throm in SimplelTk ImageFileReader_Execute:D:la1sitk\CodeI0srcsitkImageReaderBase.cxx:105: sitk::ERROR: Unable to determine ImagelD reader for "D:zuj\fx05(IOSUDA-master datasetsreti
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageSeriesReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:102:
09-11
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageSeriesReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:102: 是指在使用SimpleITK的ImageSeriesReader时发生的运行时错误。这个错误通常是由于...
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:97:
09-16
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:97是由于路径不正确导致的错误。根据引用中的解释，路径中既有/又有\，而我们设置的根...
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Show: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageViewer.cxx:620:
10-11
解决方法包括检查文件路径、重新安装 SimpleITK 库或者更换显示设备等。 示例代码： ```python import SimpleITK as sitk # 读取图像文件 image = sitk.ReadImage("path/to/image") # 显示图像 sitk.Show(image)...
【数据处理】Python读取.dcm文件的方法(解决报错:Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: D:\a\1\sitk\Cod)
qq_43426908的博客
01-10 5191
一、SimpleITK读取 import SimpleITK import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt image = SimpleITK.ReadImage(r"G:5511-2-00001.dcm") image = np.squeeze(SimpleITK.GetArrayFromImage(image)) plt.imshow(image) plt.show() SimpleITK有个缺点是：dcm文件的路径中不能含有中文，否则会报
使用SimpleITK过程中出现的WARNING
qq_43766459的博客
03-28 579
使用SimpleITK处理医学图像过程中出现的WARNING：`
python加simpleITK读取CT图像遇到的问题
qq_40433890的博客
10-22 8500
在python加simpleITK读取CT序列文件时出现问题 代码为：ct_path = r"D:\路径\ct" dicom_reader = sitk.ImageSeriesReader() dicom_file_names =dicom_reader.GetGDCMSeriesFileNames(ct_path) if not dicom_file_names: pass dicom_reader.SetFileNames(dicom_file_names) dicom_image = dicom_re
Brats 脑肿瘤分割hausdroff95计算
hpulittle_804的博客
06-30 5213
问题： 使用3d网络模型分割，分割出来的结果与真值图计算hd95，网上查找了许多办法，但大多都是2d的计算方式，不适用我的结果，又或者是因为我没有想到适用我的方法。最终找到一个medpy函数库计算hd95的值。 medpy函数库详情参考链接：http://loli.github.io/medpy/generated/medpy.metric.binary.hd.html#medpy.metric.binary.hd 使用方法： from medpy.metric import binary #计
pytorch在网络训练中，读取数据时出现问题
weixin_44262126的博客
01-12 3963
Starting epoch 1/100. ---------- Traceback (most recent call last): File "E:/Sharm Zhao/3D_U-net/train.py", line 89, in <module> label_transforms=y_transforms) File "E:/Sharm Zhao/3D_U-n...
使用SimpleITK读取和保存NIfTI文件
qq_32863339的博客
03-07 3106
## using simpleITK to load and save data. import SimpleITK as sitk itk_img = sitk.ReadImage('./***.nii.gz') img = sitk.GetArrayFromImage(itk_img) print("img shape:",img.shape) ## save out = sitk.Ge...
Windows下使用SimpleITK 进行N4BiasFieldCorrection（n4偏置校正）时出现RuntimeError
chen499093551的博客
04-19 4282
报错信息： RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK N4BiasFieldCorrectionImageFilter_Execute: c:\b\3.6-64\itk-prefix\include\itk-4.13\itkImageToImageFilter.hxx:241: itk::ERROR: SubtractImageFilter(000...
评论 6
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值