集群机器搭建多节点MPI运行环境

1、各个节点安装MPI：

https://blog.csdn.net/liu_feng_zi_/article/details/94286438

2、软硬件环境：

1、节点：

3个节点：node1，node2，node3

2、系统

操作系统：Centos 7

3、多节点配置

1、host配置：

通过下面命令打开host文件
vim /etc/hosts

在每个节点的host文件内添加ip地址和主机名，例如：
10.10.1.12  node1
10.10.1.56  node2
10.10.1.23  node3

执行一下host文件
source /etc/hosts

配置成功后，可以使用ping来测试是否修改成功

2、配置节点间ssh免密登录

以node1和node2为例

1、ssh登录到node1，生成公钥，并发送给node2节点

cd ~/.ssh/                     
ssh-keygen -t rsa              # 直接回车
cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys

2、ssh登录到node2，执行相同的操作，并将产生的公钥发送给node1

cd ~/.ssh/                     
ssh-keygen -t rsa              
scp ./id_rsa.pub node1:~/.ssh/node2_id_rsa.pub#避免名字重复加上对应节点的前缀

3、在node1节点，将发送过来的公钥追加到authorized_keys

cat ~/.ssh/node2_id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys

4、修改文件权限并将authorized_keys文件发送给node2节点

chmod 600 ~/.ssh/authorized_keys       #可能有时不修改也不影响无密登录但还是建议修改
scp ./authorized_keys node2:~/.ssh/authorized_keys

5、把"~/.ssh/"目录下的"node1_id_rsa.pub"等文件删除掉

rm ~/.ssh/node2_id_rsa.pub

6、验证ssh无密登录

3、MPI多节点执行

mpi可以多节点执行，但是需要保证在每个节点上的相同路径下都有可执行文件，所以每次都要把可执行文件进行远程拷贝

1、新建一个执行文件host，文件内容如下，表示每个节点执行3个进程

node1:3
node2:3
node3:3

 2、执行mpi文件

mpic++  test.cpp -o mpi        #编译
scp ./mpi node2:/home/mpi      #拷贝可执行程序到node2同路径下
scp ./mpi node3:/home/mpi      #拷贝可执行程序到node3同路径下
mpirun -f host -n 9 ./mpi

4、配置NFS共享目录安装配置

服务端：node1

服务端：node2、node3

4.1 服务端配置

1、查看是否已经安装nfs

rpm -qa |grep nfs

2、没有安装则进行安装

yum -y install nfs-utils rpcbind

3、创建共享目录，一般在根目录下进行创建

mkdir /mpi

4、配置/etc/exports

vim /etc/exports

/mpi 10.10.1.56(rw,sync,root_squash)
/mpi 10.10.1.23(rw,sync,root_squash)

5、启动服务并设置开机启动

service rpcbind start
service nfs start
chkconfig --level 2345 rpcbind on
chkconfig --level 2345 nfs on

4.2 客户端配置

1、查看是否安装nfs，没有则进行安装

2、查看服务端共享目录

showmount -e 10.10.1.12

若出现错误，可参考 这篇文章：

https://blog.csdn.net/liu_feng_zi_/article/details/108405064

3、挂载共享目录到本地，并测试

mount -t nfs 10.10.1.12:/mpi /mpi

cd /mpi && touch test

4、设置开机自动挂载

vim /etc/fstab
10.10.1.12:/mpi /mpi nfs defaults 0 0